Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Flrt1Q6RKD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Flrt1Q6RKD8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms