Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ptpn13Q64512 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ptpn13Q64512 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ptpn13Q64512 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ptpn13Q64512 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn13Q64512 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn13Q64512 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn13Q64512 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn13Q64512 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn13Q64512 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn13Q64512 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms