Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 MZM1YDR493W 372 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 RPS20YHL015W 366 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YML003WYML003W 873 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YBL071CYBL071C 309 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YOR121CYOR121C 306 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YOR333CYOR333C 417 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 ROX1YPR065W 1107 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 BFA1YJR053W 1725 nt2.13□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 GIP3YPL137C 3831 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 IRC8YJL051W 2469 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YGR035CYGR035C 351 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YJR011CYJR011C 786 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YMR324CYMR324C 243 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YNL010WYNL010W 726 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 DAD3YBR233W-A 285 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 RTT101YJL047C 2529 nt2.12□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 TRL1YJL087C 2484 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 MNE1YOR350C 1992 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 LSO2YGR169C-A 279 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 RTT102YGR275W 474 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 DGR1YNL130C-A 147 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 RGA1YOR127W 3024 nt2.11□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YDR286CYDR286C 345 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 RPS18BYML026C 441 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YPL238CYPL238C 390 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 SPO22YIL073C 2928 nt2.1□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 YPR146CYPR146C 330 nt2.09□□□□□ -2.07
CTF3Q12748 BUD2YKL092C 3315 nt2.09□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 CDC24YAL041W 2565 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 VPS8YAL002W 3825 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 PEX8YGR077C 1770 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 CRM1YGR218W 3255 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 GRR1YJR090C 3456 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 TMA22YJR014W 597 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YJR098CYJR098C 1971 nt2.08□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 TOF1YNL273W 3717 nt2.07□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.07□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 RTC6YPL183W-A 282 nt2.07□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 VMA9YCL005W-A 222 nt2.07□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 TOR2YKL203C 7425 nt2.07□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 KAR3YPR141C 2190 nt2.06□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 VPS35YJL154C 2835 nt2.06□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 RPL27BYDR471W 411 nt2.06□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YLR053CYLR053C 327 nt2.06□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.06□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YER121WYER121W 345 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 HOP2YGL033W 657 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 FCF2YLR051C 654 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 SWT1YOR166C 1377 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 SOK2YMR016C 2358 nt2.05□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 CDC60YPL160W 3273 nt2.04□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 ATG9YDL149W 2994 nt2.04□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 SEC31YDL195W 3822 nt2.04□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YJR003CYJR003C 1560 nt2.04□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.04□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 COS111YBR203W 2775 nt2.04□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 PEP1YBL017C 4740 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 MGM1YOR211C 2646 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 RPL40BYKR094C 387 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 CGI121YML036W 546 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 RPL9BYNL067W 576 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 SNC2YOR327C 348 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.03□□□□□ -2.08
CTF3Q12748 RIC1YLR039C 3171 nt2.02□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YKL136WYKL136W 399 nt2.02□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 PCF11YDR228C 1881 nt2.02□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 MCD1YDL003W 1701 nt2.02□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YGL024WYGL024W 336 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YNL146WYNL146W 303 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YPL225WYPL225W 441 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YSY6YBR162W-A 198 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 KIP1YBL063W 3336 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 CAT2YML042W 2013 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 CDC27YBL084C 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YDR341CYDR341C 1824 nt2.01□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 SGD1YLR336C 2700 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 SYH1YPL105C 2550 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 WIP1YDR374W-A 270 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 RPL37BYDR500C 267 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 QCR7YDR529C 384 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YAR053WYAR053W 297 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 RPL26AYLR344W 384 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YBL012CYBL012C 402 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 PGA1YNL158W 597 nt2□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 SET2YJL168C 2202 nt1.99□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 PDR8YLR266C 2106 nt1.99□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YDL011CYDL011C 324 nt1.99□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 YPL182CYPL182C 384 nt1.99□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 STB4YMR019W 2850 nt1.99□□□□□ -2.09
CTF3Q12748 MRPL31YKL138C 396 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 361.7 ms