Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.3□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 CRG1YHR209W 876 nt1.3□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YLR252WYLR252W 306 nt1.3□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 CGI121YML036W 546 nt1.3□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 SEC21YNL287W 2808 nt1.29□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 VMA21YGR105W 234 nt1.29□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YPR147CYPR147C 915 nt1.29□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.28□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 AFB1YLR040C 675 nt1.28□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 GUP1YGL084C 1683 nt1.28□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YJR098CYJR098C 1971 nt1.27□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 RPL42BYHR141C 321 nt1.27□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YJL015CYJL015C 285 nt1.27□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 RPL42AYNL162W 321 nt1.27□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YBR184WYBR184W 1572 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YHL037CYHL037C 402 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YJL022WYJL022W 309 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 SPC1YJR010C-A 285 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 ALK1YGL021W 2283 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 PBY1YBR094W 2262 nt1.26□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 MLH3YPL164C 2148 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 EST2YLR318W 2655 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 CDC36YDL165W 576 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 CIC1YHR052W 1131 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YIL029CYIL029C 429 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YJR079WYJR079W 330 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 ABM1YJR108W 372 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YOR152CYOR152C 771 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 KAP122YGL016W 3246 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 SMC4YLR086W 4257 nt1.25□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 MSN5YDR335W 3675 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 OSH6YKR003W 1347 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 PRM8YGL053W 714 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 GMC2YLR445W 567 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 FMP23YBR047W 528 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YCL046WYCL046W 324 nt1.24□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 AHC1YOR023C 1701 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 NUP192YJL039C 5052 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 VPS55YJR044C 423 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 COF1YLL050C 432 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YBL073WYBL073W 312 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 HHT1YBR010W 411 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 SFB2YNL049C 2631 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 DOT6YER088C 2013 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 PHR1YOR386W 1698 nt1.23□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 RSM22YKL155C 1887 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 SEF1YBL066C 3447 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 RVS161YCR009C 798 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 HNT1YDL125C 477 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YEL057CYEL057C 702 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 SMB1YER029C 591 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 EMC5YIL027C 426 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 PKR1YMR123W 369 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YPR146CYPR146C 330 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 MSS11YMR164C 2277 nt1.22□□□□□ -2.21
SNF8Q12483 YER121WYER121W 345 nt1.21□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 RPL33BYOR234C 324 nt1.21□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.21□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 MAK10YEL053C 2202 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 KIP1YBL063W 3336 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 MTC7YEL033W 420 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 IRC16YPR038W 360 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 IRR1YIL026C 3453 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 MVP1YMR004W 1536 nt1.2□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 SPC98YNL126W 2541 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 QCR7YDR529C 384 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YGR265WYGR265W 411 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 PAU18YLL064C 363 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 PAU6YNR076W 363 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 AZF1YOR113W 2745 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 CDC24YAL041W 2565 nt1.19□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 PPN1YDR452W 2025 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 DGR2YKL121W 2559 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 MAD1YGL086W 2250 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YDL016CYDL016C 303 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YKL123WYKL123W 381 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 RRT15YLR162W-A 189 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 SLM6YBR266C 453 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 MSH5YDL154W 2706 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 SEC5YDR166C 2916 nt1.18□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YJR141WYJR141W 1044 nt1.17□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YKL044WYKL044W 321 nt1.17□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 UBX4YMR067C 1251 nt1.17□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 DDR48YMR173W 1293 nt1.17□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 NOP15YNL110C 663 nt1.17□□□□□ -2.22
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