Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YBR197CYBR197C 654 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YJL070CYJL070C 2667 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 HOS4YIL112W 3252 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 VPS13YLL040C 9435 nt2.76□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 TMN3YER113C 2121 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 ARP8YOR141C 2646 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 MRP10YDL045W-A 288 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 LSO2YGR169C-A 279 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 AYR1YIL124W 894 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 RAM2YKL019W 951 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YOR055WYOR055W 435 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 SEC16YPL085W 6588 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 KSP1YHR082C 3090 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 PAC1YOR269W 1485 nt2.75□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 EDS1YBR033W 2760 nt2.74□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 TAR1YLR154W-C 375 nt2.74□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 SCD5YOR329C 2619 nt2.74□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 NUP120YKL057C 3114 nt2.74□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 RGA2YDR379W 3030 nt2.74□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 PRP6YBR055C 2700 nt2.73□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 QCR7YDR529C 384 nt2.73□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YPL182CYPL182C 384 nt2.73□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 IPT1YDR072C 1584 nt2.73□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 INP51YIL002C 2841 nt2.73□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 MSB1YOR188W 3414 nt2.72□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 APL5YPL195W 2799 nt2.72□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 snR51snR51 107 nt2.72□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 YNL018CYNL018C 1839 nt2.72□□□□□ -1.97
CLF1Q12309 HSC82YMR186W 2118 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 ALG13YGL047W 609 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YGL239CYGL239C 315 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YGR069WYGR069W 336 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 LSM7YNL147W 348 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 TOR1YJR066W 7413 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 MRD1YPR112C 2664 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 SNU114YKL173W 3027 nt2.71□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 REV1YOR346W 2958 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YDL062WYDL062W 426 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YFH1YDL120W 525 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 ACB1YGR037C 264 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YNL337WYNL337W 255 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 AIM9YER080W 1884 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 CSF1YLR087C 8877 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 INP53YOR109W 3324 nt2.7□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YRB1YDR002W 606 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YDR048CYDR048C 315 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YGL041CYGL041C 204 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YGL149WYGL149W 306 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 TIM13YGR181W 318 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 RTC6YPL183W-A 282 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YPR099CYPR099C 357 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 TRA1YHR099W 11235 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 VPS16YPL045W 2397 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YLL032CYLL032C 2478 nt2.69□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 KAR3YPR141C 2190 nt2.68□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 VTC1YER072W 390 nt2.68□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 PHS1YJL097W 654 nt2.68□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 LCL2YLR104W 396 nt2.68□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 STE11YLR362W 2154 nt2.67□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 MPH1YIR002C 2982 nt2.67□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 LYS9YNR050C 1341 nt2.67□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 INO80YGL150C 4470 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 SAP190YKR028W 3102 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 HTL1YCR020W-B 237 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 HSK3YKL138C-A 210 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YNL198CYNL198C 303 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YEL043WYEL043W 2871 nt2.66□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 GIS1YDR096W 2685 nt2.65□□□□□ -1.98
CLF1Q12309 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YHL041WYHL041W 450 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 HTB2YBL002W 396 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 REV3YPL167C 4515 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 DIS3YOL021C 3006 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 DBP6YNR038W 1890 nt2.65□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 RRP12YPL012W 3687 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YDR344CYDR344C 444 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YGL069CYGL069C 465 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YGR265WYGR265W 411 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 GRX8YLR364W 330 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 SAR1YPL218W 573 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 PUT3YKL015W 2940 nt2.64□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 IRA2YOL081W 9240 nt2.63□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.63□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 KTI11YBL071W-A 249 nt2.63□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 CBF2YGR140W 2871 nt2.63□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YGL024WYGL024W 336 nt2.62□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 BLI1YKL061W 342 nt2.62□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YBR277CYBR277C 402 nt2.62□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 CDC36YDL165W 576 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 BFA1YJR053W 1725 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 PTC5YOR090C 1719 nt2.61□□□□□ -1.99
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