Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 PEP3YLR148W 2757 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YBP1YBR216C 2025 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 MET32YDR253C 576 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 TRX1YLR043C 312 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YBR174CYBR174C 315 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 FIG2YCR089W 4830 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SHE9YDR393W 1371 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 MSH3YCR092C 3057 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YOR019WYOR019W 2193 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 EMC4YGL231C 573 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PKR1YMR123W 369 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 CMC2YBL059C-A 330 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PET123YOR158W 957 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 ASM4YDL088C 1587 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SEY1YOR165W 2331 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PIK1YNL267W 3201 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YGR250CYGR250C 2346 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SMB1YER029C 591 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YHL037CYHL037C 402 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 CIC1YHR052W 1131 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PFD1YJL179W 330 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 ABM1YJR108W 372 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 CGI121YML036W 546 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YOR248WYOR248W 303 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 GNT1YOR320C 1476 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SKI3YPR189W 4299 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SPC110YDR356W 2835 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PAU3YCR104W 375 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 CDC31YOR257W 486 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SPO24YPR036W-A 204 nt1.42□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 BPH1YCR032W 6504 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YDL152WYDL152W 366 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 QCR7YDR529C 384 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 YAP3YHL009C 993 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 HMI1YOL095C 2121 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PET127YOR017W 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 CCH1YGR217W 6120 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 SSK2YNR031C 4740 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 LAA1YJL207C 6045 nt1.41□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 PPN1YDR452W 2025 nt1.4□□□□□ -2.18
RRP42Q12277 NOP53YPL146C 1368 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 RPL9AYGL147C 576 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 ANS1YHR126C 480 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 FCF2YLR051C 654 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 RPS18BYML026C 441 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 snR189snR189 189 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YPR039WYPR039W 336 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 POL5YEL055C 3069 nt1.4□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 SMY1YKL079W 1971 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 KAP122YGL016W 3246 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 RLM1YPL089C 2031 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 PRE4YFR050C 801 nt1.39□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 SEF1YBL066C 3447 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 COX1Q0045 1605 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 FYV8YGR196C 2454 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 DDR48YMR173W 1293 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YPR146CYPR146C 330 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 SPC98YNL126W 2541 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 TRM732YMR259C 4263 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 SXM1YDR395W 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YBR184WYBR184W 1572 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 MSH5YDL154W 2706 nt1.38□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 CTR9YOL145C 3234 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 HUR1YGL168W 333 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 CRG1YHR209W 876 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 MCM22YJR135C 720 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YAR068WYAR068W 486 nt1.37□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YSW1YBR148W 1830 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 DOT6YER088C 2013 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 TMA22YJR014W 597 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YBR071WYBR071W 636 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.36□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 SNF5YBR289W 2718 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 DCP2YNL118C 2913 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YER135CYER135C 393 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 APQ13YJL075C 417 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 EAF6YJR082C 342 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 PAU18YLL064C 363 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 PAU6YNR076W 363 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YPR099CYPR099C 357 nt1.35□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YGR265WYGR265W 411 nt1.34□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 GPI15YNL038W 690 nt1.34□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 YBL073WYBL073W 312 nt1.34□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 snR13snR13 124 nt1.34□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 EGD1YPL037C 474 nt1.34□□□□□ -2.19
RRP42Q12277 ALK1YGL021W 2283 nt1.34□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 HKR1YDR420W 5409 nt1.34□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YGR025WYGR025W 303 nt1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48 ms