Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 SEF1YBL066C 3447 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 PRM8YGL053W 714 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 ABM1YJR108W 372 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 FCF2YLR051C 654 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 EGD1YPL037C 474 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 UBR2YLR024C 5619 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 DNF3YMR162C 4971 nt1.62□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 BST1YFL025C 3090 nt1.62□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YDL016CYDL016C 303 nt1.62□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YGR265WYGR265W 411 nt1.62□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YMR045CYMR045C 5268 nt1.61□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 REV3YPL167C 4515 nt1.61□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 MAK10YEL053C 2202 nt1.6□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.6□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 PET123YOR158W 957 nt1.6□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 PPN1YDR452W 2025 nt1.6□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 CLU1YMR012W 3834 nt1.6□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 POL5YEL055C 3069 nt1.59□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YCS4YLR272C 3531 nt1.59□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YNR025CYNR025C 360 nt1.59□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 MEI5YPL121C 669 nt1.59□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 PEP1YBL017C 4740 nt1.59□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 SXM1YDR395W 2835 nt1.59□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 NCA2YPR155C 1851 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YBP1YBR216C 2025 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YDL158CYDL158C 309 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YDR029WYDR029W 315 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 DDR48YMR173W 1293 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 IRC16YPR038W 360 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 ATG11YPR049C 3537 nt1.58□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 MSH5YDL154W 2706 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YDL152WYDL152W 366 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 NOP15YNL110C 663 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 HHT1YBR010W 411 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 SFB2YNL049C 2631 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 OSH6YKR003W 1347 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 DOT6YER088C 2013 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 SHE9YDR393W 1371 nt1.57□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 GNT1YOR320C 1476 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 CFT1YDR301W 4074 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 ATP17YDR377W 306 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 CIC1YHR052W 1131 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 UBX4YMR067C 1251 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YOL159CYOL159C 516 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YPR039WYPR039W 336 nt1.56□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 RPL42BYHR141C 321 nt1.55□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 EMC5YIL027C 426 nt1.55□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 RPL42AYNL162W 321 nt1.55□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YPR146CYPR146C 330 nt1.55□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 MSN5YDR335W 3675 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YAP3YHL009C 993 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 CTK3YML112W 891 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YBL108WYBL108W 306 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 FYV12YOR183W 390 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YBR071WYBR071W 636 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YCL023CYCL023C 348 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 DCP2YNL118C 2913 nt1.54□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 KAP122YGL016W 3246 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 BPH1YCR032W 6504 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 SNU56YDR240C 1479 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 YDR250CYDR250C 276 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 QCR7YDR529C 384 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 EMC4YGL231C 573 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 APQ13YJL075C 417 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 VPS15YBR097W 4365 nt1.53□□□□□ -2.16
NFI1Q12216 RPL9AYGL147C 576 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 BIG1YHR101C 1008 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 EAF6YJR082C 342 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 RCN2YOR220W 798 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YPR099CYPR099C 357 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 HDA3YPR179C 1968 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 SEC21YNL287W 2808 nt1.52□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 MXR1YER042W 555 nt1.51□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YNL114CYNL114C 372 nt1.51□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 ZRG17YNR039C 1818 nt1.51□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 EST2YLR318W 2655 nt1.51□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 TOF2YKR010C 2316 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 ALK1YGL021W 2283 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 HKR1YDR420W 5409 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YJL015CYJL015C 285 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 VPS55YJR044C 423 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YOR146WYOR146W 306 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 PHR1YOR386W 1698 nt1.5□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 MON2YNL297C 4911 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 TMA22YJR014W 597 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 COF1YLL050C 432 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 MLH3YPL164C 2148 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 AHC1YOR023C 1701 nt1.49□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.48□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YJL022WYJL022W 309 nt1.48□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 YLR140WYLR140W 327 nt1.48□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 PAN3YKL025C 2040 nt1.48□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 PBY1YBR094W 2262 nt1.47□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 PAU18YLL064C 363 nt1.47□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 PAU6YNR076W 363 nt1.47□□□□□ -2.17
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