Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 YDL196WYDL196W 330 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 ULI1YFR026C 510 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 COX6YHR051W 447 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 VPS25YJR102C 609 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 HSK3YKL138C-A 210 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 TAP42YMR028W 1101 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 RTR1YER139C 681 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YHR212CYHR212C 336 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 RPS24BYIL069C 408 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YAR060CYAR060C 336 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 RPL9BYNL067W 576 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 AIM41YOR215C 558 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 TRS20YBR254C 528 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 TMA20YER007C-A 546 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YLL020CYLL020C 306 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 ABF2YMR072W 552 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 OSH6YKR003W 1347 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 IRC19YLL033W 693 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 SLS1YLR139C 1932 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 COG7YGL005C 840 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 SDL1YIL167W 633 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 MUD2YKL074C 1584 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 SGD1YLR336C 2700 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 UTP10YJL109C 5310 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YBR012CYBR012C 420 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YOR282WYOR282W 321 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 NNF2YGR089W 2811 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 YCR043CYCR043C 384 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 GIC2YDR309C 1152 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-NL1Q12112 NDD1YOR372C 1665 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 DUO1YGL061C 744 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 BMT5YIL096C 1011 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YAL069WYAL069W 315 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 ATX1YNL259C 222 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 IZH4YOL101C 939 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 NUT2YPR168W 474 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 GLG1YKR058W 1851 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 TOF2YKR010C 2316 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 SWF1YDR126W 1011 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YMR324CYMR324C 243 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YJL049WYJL049W 1353 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 RPC25YKL144C 639 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YDR509WYDR509W 348 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 GRX8YLR364W 330 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 PGA1YNL158W 597 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YOL050CYOL050C 321 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 RCN1YKL159C 636 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YLR042CYLR042C 486 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 CGI121YML036W 546 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YOL150CYOL150C 312 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 GPX2YBR244W 489 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 MPT5YGL178W 2580 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YDL206WYDL206W 2289 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 VIK1YPL253C 1944 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 CYC7YEL039C 342 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YLR225CYLR225C 1224 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 NBP1YLR457C 960 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 YPL034WYPL034W 498 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 LOA1YPR139C 903 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-NL1Q12112 SLI15YBR156C 2097 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 MRPL24YMR193W 777 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YNR021WYNR021W 1215 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 PIG1YLR273C 1947 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 VAB2YEL005C 849 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YLR311CYLR311C 348 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 SEC5YDR166C 2916 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 MKT1YNL085W 2493 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YJR071WYJR071W 369 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 RPL32YBL092W 393 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 VPS74YDR372C 1038 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 SLM6YBR266C 453 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 HYM1YKL189W 1200 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 POP8YBL018C 402 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YOL024WYOL024W 519 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 PXA2YKL188C 2562 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YER046W-AYER046W-A 330 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 ISD11YER048W-A 285 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 DBP6YNR038W 1890 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 IMP3YHR148W 552 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 AEP1YMR064W 1557 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 ARP9YMR033W 1404 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-NL1Q12112 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.03□□□□□ -2.41
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