Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 YPR039WYPR039W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 CTF4YPR135W 2784 nt1.82□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 CDC24YAL041W 2565 nt1.82□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 DFG16YOR030W 1860 nt1.82□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 CHS1YNL192W 3396 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 RNH70YGR276C 1662 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 RPL16AYIL133C 600 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YAR068WYAR068W 486 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 TIF11YMR260C 462 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YNL144CYNL144C 2223 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 LHS1YKL073W 2646 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 MSH6YDR097C 3729 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 RTP1YMR185W 2946 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 MXR1YER042W 555 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 FCF2YLR051C 654 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YBR184WYBR184W 1572 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 CAT8YMR280C 4302 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 ATP17YDR377W 306 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 MTC7YEL033W 420 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 LOA1YPR139C 903 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 DDR48YMR173W 1293 nt1.78□□□□□ -2.12
SPE3Q12074 PKH3YDR466W 2697 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 NOP53YPL146C 1368 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YHR130CYHR130C 336 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 CGI121YML036W 546 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YNL122CYNL122C 348 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 PET123YOR158W 957 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YPR146CYPR146C 330 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 FRK1YPL141C 2598 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YGR250CYGR250C 2346 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 UTP21YLR409C 2820 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 CRG1YHR209W 876 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 HSL1YKL101W 4557 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 COX1Q0045 1605 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 SEF1YBL066C 3447 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 CTR9YOL145C 3234 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YSW1YBR148W 1830 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YGR290WYGR290W 444 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YHR210CYHR210C 1026 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 CMC2YBL059C-A 330 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 snR13snR13 124 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 TSC3YBR058C-A 243 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YGR045CYGR045C 363 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 DOT6YER088C 2013 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 SAC3YDR159W 3906 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 QCR7YDR529C 384 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YGR025WYGR025W 303 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 HIR3YJR140C 4947 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 IRR1YIL026C 3453 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 MSC6YOR354C 2079 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 IRA1YBR140C 9279 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 LAA1YJL207C 6045 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 TBS1YBR150C 3285 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YCR001WYCR001W 315 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 YDL152WYDL152W 366 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 FMP23YBR047W 528 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE3Q12074 TMA22YJR014W 597 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YML108WYML108W 318 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YBL073WYBL073W 312 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YOR146WYOR146W 306 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 SAR1YPL218W 573 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 MDM20YOL076W 2391 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 GNT1YOR320C 1476 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 ASM4YDL088C 1587 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 HUR1YGL168W 333 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YHR125WYHR125W 306 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 TRX1YLR043C 312 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 COA6YMR244C-A 315 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 RLM1YPL089C 2031 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YPR099CYPR099C 357 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 HMI1YOL095C 2121 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 RPL31AYDL075W 342 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 RPL42BYHR141C 321 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 RPL42AYNL162W 321 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 ABM1YJR108W 372 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YLR269CYLR269C 351 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 EGD1YPL037C 474 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YOR019WYOR019W 2193 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 BI2Q0110 1272 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 RPF1YHR088W 888 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 NBL1YHR199C-A 222 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YLR171WYLR171W 390 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 ADR1YDR216W 3972 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 SKI3YPR189W 4299 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 PAN3YKL025C 2040 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 SXM1YDR395W 2835 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 YGR265WYGR265W 411 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 FYV7YLR068W 456 nt1.66□□□□□ -2.14
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