Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

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Length 812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.14□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.14□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.14□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.14□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.14□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 RSN1YMR266W 2862 nt4.14□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 GLG1YKR058W 1851 nt4.13□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 YJL120WYJL120W 324 nt4.13□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 SEG1YMR086W 2883 nt4.13□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 SPC98YNL126W 2541 nt4.13□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 FAT1YBR041W 2010 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 SMY2YBR172C 2223 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 RPS30BYOR182C 192 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 RTC6YPL183W-A 282 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 ZDS1YMR273C 2748 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 HMI1YOL095C 2121 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 SWI1YPL016W 3945 nt4.12□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 RLI1YDR091C 1827 nt4.11□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 SBE22YHR103W 2559 nt4.11□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 VPS34YLR240W 2628 nt4.11□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 PIP2YOR363C 2991 nt4.11□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt4.11□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 IRC8YJL051W 2469 nt4.11□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 BRE4YDL231C 3378 nt4.1□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 NIP100YPL174C 2607 nt4.1□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 MLH2YLR035C 2088 nt4.1□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 YGL140CYGL140C 3660 nt4.1□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 CHD1YER164W 4407 nt4.09□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 APC11YDL008W 498 nt4.09□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt4.09□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 YNL114CYNL114C 372 nt4.09□□□□□ -1.75
IOC2Q12072 GRR1YJR090C 3456 nt4.09□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 PFF1YBR074W 2931 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 YLR149CYLR149C 2193 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 MCM7YBR202W 2538 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 PDR12YPL058C 4536 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 RAD54YGL163C 2697 nt4.08□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt4.07□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 RPL42AYNL162W 321 nt4.07□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 UTP14YML093W 2700 nt4.07□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 SWH1YAR042W 3567 nt4.07□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 NUP159YIL115C 4383 nt4.07□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 PXA2YKL188C 2562 nt4.07□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 SGM1YJR134C 2124 nt4.05□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 snR39BsnR39B 96 nt4.05□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 RCY1YJL204C 2523 nt4.05□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 HSH155YMR288W 2916 nt4.05□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 MSD1YPL104W 1977 nt4.05□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 SMT3YDR510W 306 nt4.04□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt4.04□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 YLL054CYLL054C 2532 nt4.04□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 CIN1YOR349W 3045 nt4.03□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 SOK1YDR006C 2706 nt4.03□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 SWI6YLR182W 2412 nt4.03□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 RPN2YIL075C 2838 nt4.03□□□□□ -1.76
IOC2Q12072 SNF5YBR289W 2718 nt4.02□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YFR016CYFR016C 3702 nt4.02□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 DBP10YDL031W 2988 nt4.02□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 POL1YNL102W 4407 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 SPC105YGL093W 2754 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YOL075CYOL075C 3885 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 XRS2YDR369C 2565 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 RPL14AYKL006W 417 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YJL070CYJL070C 2667 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YML002WYML002W 2214 nt4.01□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 KIN2YLR096W 3444 nt4□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 COX12YLR038C 252 nt4□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt4□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt4□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt4□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt4□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.99□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.99□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.99□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 PWP2YCR057C 2772 nt3.99□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.99□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 SPT16YGL207W 3108 nt3.99□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YIL080WYIL080W 4722 nt3.98□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 NTO1YPR031W 2247 nt3.97□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 MNE1YOR350C 1992 nt3.97□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 FAP7YDL166C 594 nt3.97□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.97□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 YKL050CYKL050C 2769 nt3.97□□□□□ -1.77
IOC2Q12072 MLH3YPL164C 2148 nt3.96□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 snR47snR47 99 nt3.96□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YDR089WYDR089W 2610 nt3.96□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 RAD34YDR314C 2079 nt3.96□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 NCR1YPL006W 3513 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 STU1YBL034C 4542 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 SPT6YGR116W 4356 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 KRE5YOR336W 4098 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 STB6YKL072W 2301 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 EMC1YCL045C 2283 nt3.95□□□□□ -1.78
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