Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 FYV12YOR183W 390 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YPL238CYPL238C 390 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YBR224WYBR224W 516 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 snR54snR54 86 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 COX1Q0045 1605 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 LYS9YNR050C 1341 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 DAS1YJL149W 1992 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 PEP3YLR148W 2757 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 SLM1YIL105C 2061 nt1.86□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 HSH155YMR288W 2916 nt1.86□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 RBK1YCR036W 1002 nt1.86□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 ECL1YGR146C 636 nt1.86□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YLR269CYLR269C 351 nt1.86□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 TSC3YBR058C-A 243 nt1.86□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 LRE1YCL051W 1752 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 SMY1YKL079W 1971 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 CMC2YBL059C-A 330 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YBL083CYBL083C 426 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 IRC20YLR247C 4671 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 VPS34YLR240W 2628 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 TBS1YBR150C 3285 nt1.85□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YSW1YBR148W 1830 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 CHC1YGL206C 4962 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 BTT1YDR252W 450 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 QCR7YDR529C 384 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 RPF1YHR088W 888 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 NBL1YHR199C-A 222 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YJL007CYJL007C 315 nt1.84□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YDL152WYDL152W 366 nt1.83□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 TIF11YMR260C 462 nt1.83□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YPR146CYPR146C 330 nt1.83□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 MYO4YAL029C 4416 nt1.83□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YNL144CYNL144C 2223 nt1.83□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 MSH6YDR097C 3729 nt1.83□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.82□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 KIP1YBL063W 3336 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YBR184WYBR184W 1572 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YHR210CYHR210C 1026 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 SEC63YOR254C 1992 nt1.81□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 RTP1YMR185W 2946 nt1.8□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YER135CYER135C 393 nt1.8□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.8□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.8□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 SEF1YBL066C 3447 nt1.8□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 PKH3YDR466W 2697 nt1.8□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 BPH1YCR032W 6504 nt1.79□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 CFT1YDR301W 4074 nt1.79□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 UTP21YLR409C 2820 nt1.79□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 SEY1YOR165W 2331 nt1.79□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 REV3YPL167C 4515 nt1.79□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 SNF5YBR289W 2718 nt1.78□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 CGI121YML036W 546 nt1.78□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 TOM22YNL131W 459 nt1.78□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 EGD1YPL037C 474 nt1.78□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YPR099CYPR099C 357 nt1.78□□□□□ -2.12
VPS54Q12071 YJR039WYJR039W 3366 nt1.78□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 GNT1YOR320C 1476 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 PAU3YCR104W 375 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 NFU1YKL040C 771 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YLR101CYLR101C 396 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 DOT6YER088C 2013 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 TFC8YPL007C 1767 nt1.77□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 LHS1YKL073W 2646 nt1.76□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 MYO2YOR326W 4725 nt1.76□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.76□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 URM1YIL008W 300 nt1.76□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 ABM1YJR108W 372 nt1.76□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 snR41snR41 95 nt1.76□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YGR250CYGR250C 2346 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 CRG1YHR209W 876 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 COA6YMR244C-A 315 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YBL073WYBL073W 312 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 ERP4YOR016C 624 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 SAR1YPL218W 573 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 TRM3YDL112W 4311 nt1.75□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 PAN3YKL025C 2040 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 VPS15YBR097W 4365 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YKL063CYKL063C 504 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 ZEO1YOL109W 342 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YBR032WYBR032W 303 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 MSC6YOR354C 2079 nt1.74□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.73□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.73□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YPL205CYPL205C 345 nt1.73□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 HIR3YJR140C 4947 nt1.73□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 CTR9YOL145C 3234 nt1.72□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 TOF2YKR010C 2316 nt1.72□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 YGL239CYGL239C 315 nt1.72□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 VPS20YMR077C 666 nt1.72□□□□□ -2.13
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