Protein–RNA interactions for Protein: Q12046

CWC2, Pre-mRNA-splicing factor CWC2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC2Q12046 VPS13YLL040C 9435 nt2.48□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 CLN3YAL040C 1743 nt2.48□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 YKU80YMR106C 1890 nt2.48□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 SPF1YEL031W 3648 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 SPO22YIL073C 2928 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 YDL152WYDL152W 366 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 RPS27AYKL156W 249 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 YMR320WYMR320W 306 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 YDR239CYDR239C 2364 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 SMY1YKL079W 1971 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 KRE33YNL132W 3171 nt2.47□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 YEF3YLR249W 3135 nt2.46□□□□□ -2.01
CWC2Q12046 TRA1YHR099W 11235 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 TOF2YKR010C 2316 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YLR149CYLR149C 2193 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 ORC2YBR060C 1863 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YGL069CYGL069C 465 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 MAM33YIL070C 801 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 SCP160YJL080C 3669 nt2.46□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YDR102CYDR102C 333 nt2.45□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YHL037CYHL037C 402 nt2.45□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 TIM18YOR297C 579 nt2.45□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 PAN3YKL025C 2040 nt2.45□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 IRA2YOL081W 9240 nt2.45□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 NOT5YPR072W 1683 nt2.44□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 SCH9YHR205W 2475 nt2.44□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.44□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 EDS1YBR033W 2760 nt2.44□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 SNF5YBR289W 2718 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 HYP2YEL034W 474 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 ACM1YPL267W 630 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YBR184WYBR184W 1572 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 PSD2YGR170W 3417 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 PEP3YLR148W 2757 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 MET18YIL128W 3099 nt2.43□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 VTC3YPL019C 2508 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YDR286CYDR286C 345 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YBR224WYBR224W 516 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 SMC6YLR383W 3345 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 MGM1YOR211C 2646 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YBP1YBR216C 2025 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 SEF1YBL066C 3447 nt2.42□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 DFG16YOR030W 1860 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 BUB1YGR188C 3066 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 STB4YMR019W 2850 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 APL5YPL195W 2799 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 MNL2YLR057W 2550 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 PAU8YAL068C 363 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 HCH1YNL281W 462 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 PAU20YOL161C 363 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 LYS9YNR050C 1341 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 ALK2YBL009W 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
CWC2Q12046 RBK1YCR036W 1002 nt2.4□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YDR413CYDR413C 576 nt2.4□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 RPL32YBL092W 393 nt2.4□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 DAD3YBR233W-A 285 nt2.4□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SAP185YJL098W 3177 nt2.4□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 IRC8YJL051W 2469 nt2.4□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 RKM1YPL208W 1752 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 NHP2YDL208W 471 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YER097WYER097W 330 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YIL059CYIL059C 366 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YOR333CYOR333C 417 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SGM1YJR134C 2124 nt2.39□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 ZRG8YER033C 3231 nt2.38□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 RPL39YJL189W 156 nt2.38□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SET2YJL168C 2202 nt2.38□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SIR3YLR442C 2937 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SAP190YKR028W 3102 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SGO1YOR073W 1773 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 PHS1YJL097W 654 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 RPA34YJL148W 702 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 MNE1YOR350C 1992 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 GUP1YGL084C 1683 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SWR1YDR334W 4545 nt2.37□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 VPS8YAL002W 3825 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 IRR1YIL026C 3453 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YER181CYER181C 324 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 RPS17AYML024W 411 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 HHT1YBR010W 411 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 PEX8YGR077C 1770 nt2.36□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YPP1YGR198W 2454 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 SLM1YIL105C 2061 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 GRR1YJR090C 3456 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YDR008CYDR008C 351 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 GCN4YEL009C 846 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YBL083CYBL083C 426 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 snR36snR36 182 nt2.35□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 PHO2YDL106C 1680 nt2.34□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.34□□□□□ -2.03
CWC2Q12046 PRE4YFR050C 801 nt2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms