Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MitfQ08874 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MitfQ08874 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MitfQ08874 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms