Protein–RNA interactions for Protein: Q06683

IRC3, Putative ATP-dependent helicase IRC3, yeastyeast

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IRC3Q06683 YEL043WYEL043W 2871 nt2.64□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 SSE1YPL106C 2082 nt2.64□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 NPR1YNL183C 2373 nt2.64□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 INP51YIL002C 2841 nt2.64□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 KIP1YBL063W 3336 nt2.63□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YDL011CYDL011C 324 nt2.63□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 HYR1YIR037W 492 nt2.63□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YJL015CYJL015C 285 nt2.63□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 RPL25YOL127W 429 nt2.63□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 RGA2YDR379W 3030 nt2.63□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YLL032CYLL032C 2478 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 RKM1YPL208W 1752 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 RPL35AYDL191W 363 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 DAD4YDR320C-A 219 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YJL016WYJL016W 1686 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 BNR1YIL159W 4128 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 CLN3YAL040C 1743 nt2.62□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YPK1YKL126W 2043 nt2.61□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 ALK2YBL009W 2031 nt2.61□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 ADK1YDR226W 669 nt2.61□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.61□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 BNI1YNL271C 5862 nt2.61□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YIL166CYIL166C 1629 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 SEC16YPL085W 6588 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 UTP30YKR060W 825 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 RPL36AYMR194W 303 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 ECM5YMR176W 4236 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 TUS1YLR425W 3924 nt2.6□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 SIR4YDR227W 4077 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 IRC10YOL015W 1761 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 GYP5YPL249C 2685 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 snR79snR79 84 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 TIM9YEL020W-A 264 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YGL041CYGL041C 204 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 ALG13YGL047W 609 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YMR324CYMR324C 243 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 YPR099CYPR099C 357 nt2.59□□□□□ -1.99
IRC3Q06683 GIS1YDR096W 2685 nt2.59□□□□□ -2
IRC3Q06683 KSP1YHR082C 3090 nt2.59□□□□□ -2
IRC3Q06683 SNU114YKL173W 3027 nt2.58□□□□□ -2
IRC3Q06683 YDL062WYDL062W 426 nt2.58□□□□□ -2
IRC3Q06683 RPL40AYIL148W 387 nt2.58□□□□□ -2
IRC3Q06683 YLR294CYLR294C 330 nt2.58□□□□□ -2
IRC3Q06683 SGO1YOR073W 1773 nt2.58□□□□□ -2
IRC3Q06683 PRK1YIL095W 2433 nt2.58□□□□□ -2
IRC3Q06683 YPR089WYPR089W 2667 nt2.57□□□□□ -2
IRC3Q06683 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.57□□□□□ -2
IRC3Q06683 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.57□□□□□ -2
IRC3Q06683 YPR146CYPR146C 330 nt2.57□□□□□ -2
IRC3Q06683 BRO1YPL084W 2535 nt2.57□□□□□ -2
IRC3Q06683 NAN1YPL126W 2691 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 SWR1YDR334W 4545 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 ASG1YIL130W 2895 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 RPS17BYDR447C 411 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 YGR069WYGR069W 336 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 TAR1YLR154W-C 375 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 PAC1YOR269W 1485 nt2.56□□□□□ -2
IRC3Q06683 PRP6YBR055C 2700 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 YPR097WYPR097W 3222 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 RPL32YBL092W 393 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 LYS9YNR050C 1341 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 SVL3YPL032C 2478 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 snR51snR51 107 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 KOG1YHR186C 4674 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 NUP120YKL057C 3114 nt2.55□□□□□ -2
IRC3Q06683 MZM1YDR493W 372 nt2.54□□□□□ -2
IRC3Q06683 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.54□□□□□ -2
IRC3Q06683 YER121WYER121W 345 nt2.54□□□□□ -2
IRC3Q06683 RPS18BYML026C 441 nt2.54□□□□□ -2
IRC3Q06683 TAE2YPL009C 3117 nt2.54□□□□□ -2
IRC3Q06683 ACB1YGR037C 264 nt2.53□□□□□ -2
IRC3Q06683 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.53□□□□□ -2
IRC3Q06683 BLI1YKL061W 342 nt2.53□□□□□ -2
IRC3Q06683 TRM7YBR061C 933 nt2.53□□□□□ -2
IRC3Q06683 SSD1YDR293C 3753 nt2.53□□□□□ -2
IRC3Q06683 YFR016CYFR016C 3702 nt2.53□□□□□ -2
IRC3Q06683 TFC3YAL001C 3483 nt2.52□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 VPS16YPL045W 2397 nt2.52□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 YCK3YER123W 1575 nt2.52□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 TRA1YHR099W 11235 nt2.52□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 CBF2YGR140W 2871 nt2.51□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 YGL149WYGL149W 306 nt2.51□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 YGR265WYGR265W 411 nt2.51□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 YJL070CYJL070C 2667 nt2.51□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 MSS11YMR164C 2277 nt2.51□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 UFD4YKL010C 4452 nt2.5□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 AFI1YOR129C 2682 nt2.5□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 CDC36YDL165W 576 nt2.5□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 YDR048CYDR048C 315 nt2.5□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 PSO2YMR137C 1986 nt2.49□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 HTL1YCR020W-B 237 nt2.49□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 QCR7YDR529C 384 nt2.49□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 LSO2YGR169C-A 279 nt2.49□□□□□ -2.01
IRC3Q06683 PAM16YJL104W 450 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.9 ms