Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 YPR147CYPR147C 915 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YLR422WYLR422W 5799 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 ADR1YDR216W 3972 nt0.93□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SMY1YKL079W 1971 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 NUP188YML103C 4968 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SCC2YDR180W 4482 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YDL187CYDL187C 330 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 RPL42BYHR141C 321 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 RCN1YKL159C 636 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 RPL42AYNL162W 321 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YOR152CYOR152C 771 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 RBL2YOR265W 321 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 MLH3YPL164C 2148 nt0.92□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 UTP13YLR222C 2454 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SEC28YIL076W 891 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YKL111CYKL111C 336 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 PAU18YLL064C 363 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YNL114CYNL114C 372 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 PAU6YNR076W 363 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 LAA1YJL207C 6045 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 SFB2YNL049C 2631 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YBR184WYBR184W 1572 nt0.91□□□□□ -2.26
CUE4Q04201 YER121WYER121W 345 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YGL024WYGL024W 336 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 EMC5YIL027C 426 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 RPL40BYKR094C 387 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 RRT15YLR162W-A 189 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YOR376WYOR376W 369 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 AFR1YDR085C 1863 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 DOP1YDR141C 5097 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 CDC24YAL041W 2565 nt0.9□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SEF1YBL066C 3447 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 TRM3YDL112W 4311 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SPT7YBR081C 3999 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YJR079WYJR079W 330 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 DDR48YMR173W 1293 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SWS2YNL081C 432 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 NST1YNL091W 3723 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SNF5YBR289W 2718 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 MSS11YMR164C 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SKP2YNL311C 2292 nt0.89□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 AZF1YOR113W 2745 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 UFD2YDL190C 2886 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 GPM2YDL021W 936 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SMB1YER029C 591 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 CHZ1YER030W 462 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SLX9YGR081C 633 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YGR265WYGR265W 411 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 PRP21YJL203W 843 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YOL029CYOL029C 606 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 FMP23YBR047W 528 nt0.88□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 QCR7YDR529C 384 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YGL217CYGL217C 342 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YLR252WYLR252W 306 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 IRR1YIL026C 3453 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YJR098CYJR098C 1971 nt0.87□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 CDC39YCR093W 6327 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 RAD50YNL250W 3939 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YJR029WYJR029W 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 MSN5YDR335W 3675 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YDL152WYDL152W 366 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YDL211CYDL211C 1119 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SPO13YHR014W 876 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 TIM18YOR297C 579 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YPR063CYPR063C 423 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YPR146CYPR146C 330 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.86□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 ZRG17YNR039C 1818 nt0.85□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YBL073WYBL073W 312 nt0.85□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 snR14snR14 160 nt0.85□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SLX4YLR135W 2247 nt0.85□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SMC1YFL008W 3678 nt0.85□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 MAK10YEL053C 2202 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 SRP14YDL092W 441 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 snR78snR78 87 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 PAU2YEL049W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 PKR1YMR123W 369 nt0.84□□□□□ -2.27
CUE4Q04201 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 HDA3YPR179C 1968 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SEC5YDR166C 2916 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.8 ms