Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 TTI1YKL033W 3117 nt0.6□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 LSO2YGR169C-A 279 nt0.59□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 CRG1YHR209W 876 nt0.59□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YDL073WYDL073W 2955 nt0.59□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 CDC24YAL041W 2565 nt0.58□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 TOF2YKR010C 2316 nt0.58□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 SMD3YLR147C 306 nt0.58□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 VPS63YLR261C 327 nt0.58□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.58□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RUB1YDR139C 234 nt0.57□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 VPS74YDR372C 1038 nt0.57□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 NUT1YGL151W 3399 nt0.57□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 CHZ1YER030W 462 nt0.56□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt0.56□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 DIA1YMR316W 1011 nt0.56□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 UBP3YER151C 2739 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 NUP82YJL061W 2142 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YDR248CYDR248C 582 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RPL16AYIL133C 600 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YLR366WYLR366W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 GIM5YML094W 492 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 TYE7YOR344C 876 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 NUP157YER105C 4176 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 REF2YDR195W 1602 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 KAR3YPR141C 2190 nt0.55□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RMD6YEL072W 696 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 SMB1YER029C 591 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 IES5YER092W 378 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 PAU18YLL064C 363 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RPS7BYNL096C 573 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 PAU6YNR076W 363 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 UFE1YOR075W 1041 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YBR012CYBR012C 420 nt0.54□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YBR184WYBR184W 1572 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 NHP2YDL208W 471 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 MXR1YER042W 555 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YGR045CYGR045C 363 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RPL42BYHR141C 321 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 GPX1YKL026C 504 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 NBP1YLR457C 960 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RPL42AYNL162W 321 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 SUS1YBR111W-A 291 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.53□□□□□ -2.32
PKR1Q03880 RIM20YOR275C 1986 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YDL068WYDL068W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YCL020WYCL020W 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 MPT5YGL178W 2580 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YDL206WYDL206W 2289 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 SWF1YDR126W 1011 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 TIM8YJR135W-A 264 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 RKR1YMR247C 4689 nt0.51□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YDL196WYDL196W 330 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YDR521WYDR521W 336 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 RNR4YGR180C 1038 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 RTT102YGR275W 474 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 CMC4YMR194C-B 222 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 SET3YKR029C 2256 nt0.5□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 PRP16YKR086W 3216 nt0.49□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 NOC3YLR002C 1992 nt0.49□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 BMT5YIL096C 1011 nt0.49□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.49□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YGL109WYGL109W 324 nt0.48□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 LSM12YHR121W 564 nt0.48□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 RPL38YLR325C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YPR172WYPR172W 603 nt0.48□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 PIG1YLR273C 1947 nt0.47□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 PAM16YJL104W 450 nt0.47□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 YOR199WYOR199W 330 nt0.47□□□□□ -2.33
PKR1Q03880 HDA3YPR179C 1968 nt0.46□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SWI6YLR182W 2412 nt0.46□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 GPM2YDL021W 936 nt0.46□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.46□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 NUT2YPR168W 474 nt0.46□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.45□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 OST5YGL226C-A 261 nt0.45□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 ANS1YHR126C 480 nt0.45□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SHE9YDR393W 1371 nt0.45□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SRP14YDL092W 441 nt0.44□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 DAD1YDR016C 285 nt0.44□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 TMA22YJR014W 597 nt0.44□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SLM6YBR266C 453 nt0.44□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 AIM44YPL158C 2277 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 STO1YMR125W 2586 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.5 ms