Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Xrn1P97789 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn1P97789 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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