Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 GIC2YDR309C 1152 nt0.31□□□□□ -2.36
PDR11P40550 YGL109WYGL109W 324 nt0.31□□□□□ -2.36
PDR11P40550 RPC25YKL144C 639 nt0.31□□□□□ -2.36
PDR11P40550 AME1YBR211C 975 nt0.31□□□□□ -2.36
PDR11P40550 TRS20YBR254C 528 nt0.31□□□□□ -2.36
PDR11P40550 VAB2YEL005C 849 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 CYC7YEL039C 342 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 MXR1YER042W 555 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 HYM1YKL189W 1200 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 AEP1YMR064W 1557 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 SPT21YMR179W 2277 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 AI5_BETAQ0075 1065 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 POP8YBL018C 402 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 RPL9BYNL067W 576 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 ICS2YBR157C 768 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 snR45snR45 172 nt0.3□□□□□ -2.36
PDR11P40550 YDR199WYDR199W 366 nt0.29□□□□□ -2.36
PDR11P40550 IZH4YOL101C 939 nt0.29□□□□□ -2.36
PDR11P40550 FMP23YBR047W 528 nt0.29□□□□□ -2.36
PDR11P40550 SUT2YPR009W 807 nt0.29□□□□□ -2.36
PDR11P40550 BEM3YPL115C 3387 nt0.28□□□□□ -2.36
PDR11P40550 TAD1YGL243W 1203 nt0.28□□□□□ -2.37
PDR11P40550 PEX34YCL056C 435 nt0.28□□□□□ -2.37
PDR11P40550 NGG1YDR176W 2109 nt0.27□□□□□ -2.37
PDR11P40550 TOF2YKR010C 2316 nt0.27□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YJL114WYJL114W 681 nt0.27□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YET2YMR040W 483 nt0.27□□□□□ -2.37
PDR11P40550 RCN1YKL159C 636 nt0.26□□□□□ -2.37
PDR11P40550 NDD1YOR372C 1665 nt0.26□□□□□ -2.37
PDR11P40550 ARP9YMR033W 1404 nt0.26□□□□□ -2.37
PDR11P40550 BMT5YIL096C 1011 nt0.25□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YKE2YLR200W 345 nt0.25□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YNR021WYNR021W 1215 nt0.25□□□□□ -2.37
PDR11P40550 OSH6YKR003W 1347 nt0.25□□□□□ -2.37
PDR11P40550 COG7YGL005C 840 nt0.24□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YAL064WYAL064W 285 nt0.24□□□□□ -2.37
PDR11P40550 GMC2YLR445W 567 nt0.24□□□□□ -2.37
PDR11P40550 ATP18YML081C-A 180 nt0.24□□□□□ -2.37
PDR11P40550 ATX1YNL259C 222 nt0.24□□□□□ -2.37
PDR11P40550 DUO1YGL061C 744 nt0.23□□□□□ -2.37
PDR11P40550 MMS2YGL087C 414 nt0.23□□□□□ -2.37
PDR11P40550 CGI121YML036W 546 nt0.23□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YOL024WYOL024W 519 nt0.23□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YBR012CYBR012C 420 nt0.23□□□□□ -2.37
PDR11P40550 SWF1YDR126W 1011 nt0.22□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.22□□□□□ -2.37
PDR11P40550 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.22□□□□□ -2.37
PDR11P40550 ABF2YMR072W 552 nt0.22□□□□□ -2.37
PDR11P40550 NNF2YGR089W 2811 nt0.22□□□□□ -2.37
PDR11P40550 NUR1YDL089W 1455 nt0.22□□□□□ -2.37
PDR11P40550 EDC1YGL222C 528 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YGR045CYGR045C 363 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 NBP1YLR457C 960 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 snR13snR13 124 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 VPS28YPL065W 729 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 NUT2YPR168W 474 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YBR224WYBR224W 516 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 NUT1YGL151W 3399 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 RSM27YGR215W 333 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YJL032WYJL032W 315 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 SPC2YML055W 537 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.21□□□□□ -2.38
PDR11P40550 PIG1YLR273C 1947 nt0.2□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YDL196WYDL196W 330 nt0.2□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.19□□□□□ -2.38
PDR11P40550 MUM2YBR057C 1101 nt0.19□□□□□ -2.38
PDR11P40550 GPX2YBR244W 489 nt0.19□□□□□ -2.38
PDR11P40550 SLM6YBR266C 453 nt0.19□□□□□ -2.38
PDR11P40550 ULI1YFR026C 510 nt0.18□□□□□ -2.38
PDR11P40550 FAR3YMR052W 615 nt0.18□□□□□ -2.38
PDR11P40550 SLS1YLR139C 1932 nt0.18□□□□□ -2.38
PDR11P40550 RPS24BYIL069C 408 nt0.17□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YOR199WYOR199W 330 nt0.17□□□□□ -2.38
PDR11P40550 ESP1YGR098C 4893 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 KEG1YFR042W 603 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YJR071WYJR071W 369 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YAR053WYAR053W 297 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 RPL32YBL092W 393 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 IES4YOR189W 351 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YDL206WYDL206W 2289 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR11P40550 NUP120YKL057C 3114 nt0.15□□□□□ -2.38
PDR11P40550 YCR016WYCR016W 873 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR11P40550 YDR262WYDR262W 819 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR11P40550 YGR265WYGR265W 411 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR11P40550 GLG1YKR058W 1851 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR11P40550 YOL150CYOL150C 312 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR11P40550 NOT5YPR072W 1683 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR11P40550 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR11P40550 NEJ1YLR265C 1029 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR11P40550 SWM2YNR004W 441 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR11P40550 YBP2YGL060W 1926 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR11P40550 snR63snR63 255 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR11P40550 ALG13YGL047W 609 nt0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms