Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 FMP23YBR047W 528 nt2.59□□□□□ -1.99
VID28P40547 YPL229WYPL229W 621 nt2.59□□□□□ -1.99
VID28P40547 SGM1YJR134C 2124 nt2.59□□□□□ -2
VID28P40547 HSC82YMR186W 2118 nt2.59□□□□□ -2
VID28P40547 DOT6YER088C 2013 nt2.58□□□□□ -2
VID28P40547 YBP1YBR216C 2025 nt2.58□□□□□ -2
VID28P40547 CBF2YGR140W 2871 nt2.58□□□□□ -2
VID28P40547 PEX4YGR133W 552 nt2.58□□□□□ -2
VID28P40547 NOP10YHR072W-A 177 nt2.58□□□□□ -2
VID28P40547 RRP6YOR001W 2202 nt2.58□□□□□ -2
VID28P40547 SPF1YEL031W 3648 nt2.57□□□□□ -2
VID28P40547 YEF3YLR249W 3135 nt2.57□□□□□ -2
VID28P40547 PRE4YFR050C 801 nt2.57□□□□□ -2
VID28P40547 RPL39YJL189W 156 nt2.57□□□□□ -2
VID28P40547 YPR099CYPR099C 357 nt2.57□□□□□ -2
VID28P40547 GIS1YDR096W 2685 nt2.57□□□□□ -2
VID28P40547 UBP1YDL122W 2430 nt2.56□□□□□ -2
VID28P40547 VTC1YER072W 390 nt2.56□□□□□ -2
VID28P40547 RPS27AYKL156W 249 nt2.56□□□□□ -2
VID28P40547 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.56□□□□□ -2
VID28P40547 snR36snR36 182 nt2.56□□□□□ -2
VID28P40547 SWR1YDR334W 4545 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 REV3YPL167C 4515 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 YIL080WYIL080W 4722 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 YFL032WYFL032W 321 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 AFI1YOR129C 2682 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 ACM1YPL267W 630 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 SMC6YLR383W 3345 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 RIC1YLR039C 3171 nt2.55□□□□□ -2
VID28P40547 YNL018CYNL018C 1839 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 CRM1YGR218W 3255 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 snR65snR65 100 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 TWF1YGR080W 999 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 HCH1YNL281W 462 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 VMA9YCL005W-A 222 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 VPS13YLL040C 9435 nt2.54□□□□□ -2
VID28P40547 YOL098CYOL098C 3114 nt2.53□□□□□ -2
VID28P40547 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.53□□□□□ -2
VID28P40547 MRPL33YMR286W 261 nt2.53□□□□□ -2
VID28P40547 IRA2YOL081W 9240 nt2.53□□□□□ -2
VID28P40547 RKM1YPL208W 1752 nt2.53□□□□□ -2
VID28P40547 TOF2YKR010C 2316 nt2.52□□□□□ -2.01
VID28P40547 SAP190YKR028W 3102 nt2.52□□□□□ -2.01
VID28P40547 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.52□□□□□ -2.01
VID28P40547 SMY2YBR172C 2223 nt2.52□□□□□ -2.01
VID28P40547 SGO1YOR073W 1773 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 STE5YDR103W 2754 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 PAN3YKL025C 2040 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 TRS130YMR218C 3309 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 MGM1YOR211C 2646 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 GCN4YEL009C 846 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 SNC1YAL030W 354 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 SWA2YDR320C 2007 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 SAP185YJL098W 3177 nt2.51□□□□□ -2.01
VID28P40547 SMY1YKL079W 1971 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 CDC53YDL132W 2448 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 RBK1YCR036W 1002 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 YDR008CYDR008C 351 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 RPS29AYLR388W 171 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 CDC27YBL084C 2277 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 DFG16YOR030W 1860 nt2.5□□□□□ -2.01
VID28P40547 ALK2YBL009W 2031 nt2.49□□□□□ -2.01
VID28P40547 YGL069CYGL069C 465 nt2.49□□□□□ -2.01
VID28P40547 RPL32YBL092W 393 nt2.49□□□□□ -2.01
VID28P40547 FAR11YNL127W 2862 nt2.49□□□□□ -2.01
VID28P40547 YLR149CYLR149C 2193 nt2.49□□□□□ -2.01
VID28P40547 SPO22YIL073C 2928 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 TOP2YNL088W 4287 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 CSF1YLR087C 8877 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 ATP7YKL016C 525 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 UTP22YGR090W 3714 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 IRC8YJL051W 2469 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 YBR184WYBR184W 1572 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 SNF5YBR289W 2718 nt2.48□□□□□ -2.01
VID28P40547 ATG11YPR049C 3537 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 GUP1YGL084C 1683 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 NOT5YPR072W 1683 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 YIL059CYIL059C 366 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 YBR224WYBR224W 516 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 TUS1YLR425W 3924 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 PEP3YLR148W 2757 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 PUT3YKL015W 2940 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 SIR3YLR442C 2937 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 ISW1YBR245C 3390 nt2.47□□□□□ -2.01
VID28P40547 LYS9YNR050C 1341 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 SCH9YHR205W 2475 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 NUP100YKL068W 2880 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 SEF1YBL066C 3447 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 YCR022CYCR022C 345 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 PHS1YJL097W 654 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 YAR029WYAR029W 225 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 YMR320WYMR320W 306 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.46□□□□□ -2.02
VID28P40547 PAC1YOR269W 1485 nt2.45□□□□□ -2.02
VID28P40547 TOR1YJR066W 7413 nt2.45□□□□□ -2.02
VID28P40547 TAR1YLR154W-C 375 nt2.45□□□□□ -2.02
VID28P40547 MNL2YLR057W 2550 nt2.45□□□□□ -2.02
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