Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YSW1YBR148W 1830 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YJR098CYJR098C 1971 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YAP3YHL009C 993 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 RPS18BYML026C 441 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 NOP15YNL110C 663 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 COX1Q0045 1605 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 SHE9YDR393W 1371 nt1.72□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YOR019WYOR019W 2193 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 KCS1YDR017C 3153 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 RPL9AYGL147C 576 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 STE18YJR086W 333 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 FCF2YLR051C 654 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YBR071WYBR071W 636 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YPR153WYPR153W 423 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 UTP21YLR409C 2820 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 SKI3YPR189W 4299 nt1.71□□□□□ -2.14
SEC28P40509 SEF1YBL066C 3447 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC28P40509 FIG2YCR089W 4830 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC28P40509 CRG1YHR209W 876 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC28P40509 EAF6YJR082C 342 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC28P40509 SPO24YPR036W-A 204 nt1.7□□□□□ -2.14
SEC28P40509 RLM1YPL089C 2031 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC28P40509 ABM1YJR108W 372 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC28P40509 SYM1YLR251W 594 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YBL073WYBL073W 312 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC28P40509 FMP23YBR047W 528 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YPR039WYPR039W 336 nt1.69□□□□□ -2.14
SEC28P40509 MCM22YJR135C 720 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC28P40509 DDR48YMR173W 1293 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC28P40509 HMI1YOL095C 2121 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YOR146WYOR146W 306 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YPR146CYPR146C 330 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC28P40509 CTF4YPR135W 2784 nt1.68□□□□□ -2.14
SEC28P40509 FRK1YPL141C 2598 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC28P40509 HSL1YKL101W 4557 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC28P40509 BIG1YHR101C 1008 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YAR068WYAR068W 486 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC28P40509 BPH1YCR032W 6504 nt1.67□□□□□ -2.14
SEC28P40509 YDL152WYDL152W 366 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC28P40509 QCR7YDR529C 384 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC28P40509 SBE22YHR103W 2559 nt1.66□□□□□ -2.14
SEC28P40509 BRR2YER172C 6492 nt1.65□□□□□ -2.14
SEC28P40509 FYV12YOR183W 390 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC28P40509 DOT6YER088C 2013 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC28P40509 MON2YNL297C 4911 nt1.65□□□□□ -2.15
SEC28P40509 ATP17YDR377W 306 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YGR265WYGR265W 411 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC28P40509 APQ13YJL075C 417 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC28P40509 TRM3YDL112W 4311 nt1.64□□□□□ -2.15
SEC28P40509 GNT1YOR320C 1476 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC28P40509 MXR1YER042W 555 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC28P40509 RPL42BYHR141C 321 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC28P40509 GPI15YNL038W 690 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC28P40509 RPL42AYNL162W 321 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC28P40509 snR13snR13 124 nt1.63□□□□□ -2.15
SEC28P40509 MAK10YEL053C 2202 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 PBI2YNL015W 228 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YPR099CYPR099C 357 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 MSH5YDL154W 2706 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 BST1YFL025C 3090 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 OSH6YKR003W 1347 nt1.62□□□□□ -2.15
SEC28P40509 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC28P40509 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YNL114CYNL114C 372 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC28P40509 EGD1YPL037C 474 nt1.61□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YGR025WYGR025W 303 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 TMA22YJR014W 597 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YNL303WYNL303W 348 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 TSC3YBR058C-A 243 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 SXM1YDR395W 2835 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 YLR422WYLR422W 5799 nt1.6□□□□□ -2.15
SEC28P40509 PAN3YKL025C 2040 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC28P40509 HUR1YGL168W 333 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC28P40509 RPL16AYIL133C 600 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC28P40509 HHT1YBR010W 411 nt1.59□□□□□ -2.15
SEC28P40509 CAT8YMR280C 4302 nt1.59□□□□□ -2.16
SEC28P40509 SFB2YNL049C 2631 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC28P40509 RKM1YPL208W 1752 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC28P40509 CHS1YNL192W 3396 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC28P40509 NCA2YPR155C 1851 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC28P40509 HDA3YPR179C 1968 nt1.58□□□□□ -2.16
SEC28P40509 NUP192YJL039C 5052 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YHR130CYHR130C 336 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 PAU18YLL064C 363 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 COA6YMR244C-A 315 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 PAU6YNR076W 363 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YBR032WYBR032W 303 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 TOF2YKR010C 2316 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 KAP122YGL016W 3246 nt1.57□□□□□ -2.16
SEC28P40509 ZRG17YNR039C 1818 nt1.56□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YJL022WYJL022W 309 nt1.56□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YCL046WYCL046W 324 nt1.56□□□□□ -2.16
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