Protein–RNA interactions for Protein: P36172

VBA5, Vacuolar basic amino acid transporter 5, yeastyeast

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA5P36172 ARP7YPR034W 1434 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 TCB2YNL087W 3537 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 COG8YML071C 1824 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 snR80snR80 171 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 YBR224WYBR224W 516 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 BPT1YLL015W 4680 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 HDA3YPR179C 1968 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA5P36172 UTP14YML093W 2700 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 YPL150WYPL150W 2706 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 TFC4YGR047C 3078 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 PEP3YLR148W 2757 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 CDC27YBL084C 2277 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 YFH1YDL120W 525 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 CDC36YDL165W 576 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA5P36172 HSC82YMR186W 2118 nt2.84□□□□□ -1.96
VBA5P36172 EFR3YMR212C 2349 nt2.84□□□□□ -1.96
VBA5P36172 RSN1YMR266W 2862 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 AMS1YGL156W 3252 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YGR050CYGR050C 357 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 PHD1YKL043W 1101 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 SDH2YLL041C 801 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YOR225WYOR225W 330 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YOR333CYOR333C 417 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YPR063CYPR063C 423 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 NUT2YPR168W 474 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 SCH9YHR205W 2475 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 FRE2YKL220C 2136 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 RSE1YML049C 4086 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA5P36172 EMC6YLL014W 327 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA5P36172 CBF2YGR140W 2871 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA5P36172 SNC1YAL030W 354 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA5P36172 MCD1YDL003W 1701 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA5P36172 MNL2YLR057W 2550 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 DYN2YDR424C 279 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 ABF2YMR072W 552 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 KEL2YGR238C 2649 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 HCS1YKL017C 2052 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 DNA2YHR164C 4569 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA5P36172 SPO22YIL073C 2928 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YPP1YGR198W 2454 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA5P36172 CDC53YDL132W 2448 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA5P36172 VPS34YLR240W 2628 nt2.78□□□□□ -1.96
VBA5P36172 YDR426CYDR426C 378 nt2.78□□□□□ -1.96
VBA5P36172 TRX1YLR043C 312 nt2.78□□□□□ -1.96
VBA5P36172 UPS1YLR193C 528 nt2.78□□□□□ -1.96
VBA5P36172 SNQ2YDR011W 4506 nt2.78□□□□□ -1.96
VBA5P36172 KAP104YBR017C 2757 nt2.78□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YGR250CYGR250C 2346 nt2.77□□□□□ -1.97
VBA5P36172 INP52YNL106C 3552 nt2.77□□□□□ -1.97
VBA5P36172 GRR1YJR090C 3456 nt2.77□□□□□ -1.97
VBA5P36172 AXL1YPR122W 3627 nt2.77□□□□□ -1.97
VBA5P36172 COS111YBR203W 2775 nt2.77□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YLR255CYLR255C 354 nt2.77□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YIL174WYIL174W 228 nt2.76□□□□□ -1.97
VBA5P36172 RPS22AYJL190C 393 nt2.76□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.76□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YNL018CYNL018C 1839 nt2.76□□□□□ -1.97
VBA5P36172 STB4YMR019W 2850 nt2.76□□□□□ -1.97
VBA5P36172 GEA1YJR031C 4227 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 ZRG8YER033C 3231 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 snR70snR70 164 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YBR064WYBR064W 429 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 SWI6YLR182W 2412 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 CFT2YLR115W 2580 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 SCW11YGL028C 1629 nt2.75□□□□□ -1.97
VBA5P36172 NOP53YPL146C 1368 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 IRR1YIL026C 3453 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 MGM1YOR211C 2646 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 BCK1YJL095W 4437 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 BUB1YGR188C 3066 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 ECM29YHL030W 5607 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 snR60snR60 104 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 TUS1YLR425W 3924 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 SEC7YDR170C 6030 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 MRD1YPR112C 2664 nt2.74□□□□□ -1.97
VBA5P36172 MUK1YPL070W 1839 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 TRS130YMR218C 3309 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 CYB5YNL111C 363 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YNL114CYNL114C 372 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YBL083CYBL083C 426 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 snR43snR43 209 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 SMY2YBR172C 2223 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 MVP1YMR004W 1536 nt2.73□□□□□ -1.97
VBA5P36172 PXA2YKL188C 2562 nt2.72□□□□□ -1.97
VBA5P36172 SLM1YIL105C 2061 nt2.72□□□□□ -1.97
VBA5P36172 SET2YJL168C 2202 nt2.72□□□□□ -1.97
VBA5P36172 Q0032Q0032 291 nt2.72□□□□□ -1.97
VBA5P36172 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.72□□□□□ -1.97
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