Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna3O08545 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna3O08545 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms