Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms