Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trappc8E9PWG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc8E9PWG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms