Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd1Q61345 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd1Q61345 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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