Protein–RNA interactions for Protein: Q12501

TY2B-OR2, Transposon Ty2-OR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-OR2Q12501 VMA7YGR020C 357 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 MRPL50YNR022C 420 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 NUT1YGL151W 3399 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 PHO92YDR374C 921 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 YLL020CYLL020C 306 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 IRC19YLL033W 693 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 YDL157CYDL157C 357 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 RPB5YBR154C 648 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-OR2Q12501 RPS24BYIL069C 408 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 REX3YLR107W 1215 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 GMC2YLR445W 567 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 SPC2YML055W 537 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YPR014CYPR014C 330 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 SGO1YOR073W 1773 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 HDA3YPR179C 1968 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 UTP10YJL109C 5310 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 KEG1YFR042W 603 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 BET5YML077W 480 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YNL226WYNL226W 411 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 PFK27YOL136C 1194 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YGL109WYGL109W 324 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 AHC2YCR082W 387 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 FAR7YFR008W 666 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 ULI1YFR026C 510 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 IES4YOR189W 351 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 ALG5YPL227C 1005 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 DSE1YER124C 1722 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 DAS1YJL149W 1992 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 PSO2YMR137C 1986 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YBL077WYBL077W 432 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 GLG1YKR058W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 FYV4YHR059W 393 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 NBP1YLR457C 960 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 MGR1YCL044C 1254 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 SRB4YER022W 2064 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 DUO1YGL061C 744 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 EMC5YIL027C 426 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YIR020CYIR020C 303 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 ABF2YMR072W 552 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 GDS1YOR355W 1569 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 MSC6YOR354C 2079 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 TSA2YDR453C 591 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YFR054CYFR054C 579 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 UPF3YGR072W 1164 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 YMR099CYMR099C 894 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 RTR1YER139C 681 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 HAL9YOL089C 3093 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-OR2Q12501 SDL1YIL167W 633 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YMR324CYMR324C 243 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 PXA2YKL188C 2562 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 BFR1YOR198C 1413 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 NUP120YKL057C 3114 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 GIC1YHR061C 945 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 RPL40BYKR094C 387 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 RPS10AYOR293W 318 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 FIG1YBR040W 897 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 CIN2YPL241C 807 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 ENV11YGR071C 2583 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YDL206WYDL206W 2289 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 MXR1YER042W 555 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YOL050CYOL050C 321 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 LOA1YPR139C 903 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 snR68snR68 136 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 TCA17YEL048C 459 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 SLX4YLR135W 2247 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 AFR1YDR085C 1863 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 VIK1YPL253C 1944 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 NOP10YHR072W-A 177 nt0.05□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 ARL3YPL051W 597 nt0.05□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 SMD1YGR074W 441 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 LAG1YHL003C 1236 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 RPI1YIL119C 1224 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 NIP100YPL174C 2607 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 RPL32YBL092W 393 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 SEC5YDR166C 2916 nt0.03□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.03□□□□□ -2.4
TY2B-OR2Q12501 MLP1YKR095W 5628 nt0.03□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 TIF11YMR260C 462 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 snR35snR35 204 nt0.02□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 BMT5YIL096C 1011 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 POP8YBL018C 402 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 VPS74YDR372C 1038 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 RSM28YDR494W 1086 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 RAM2YKL019W 951 nt0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 SPT21YMR179W 2277 nt0□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 DBP6YNR038W 1890 nt-0□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 BFA1YJR053W 1725 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 CYC7YEL039C 342 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY2B-OR2Q12501 YGL217CYGL217C 342 nt-0.01□□□□□ -2.41
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