Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 IRC10YOL015W 1761 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 SBE22YHR103W 2559 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 EMP24YGL200C 612 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 LSO2YGR169C-A 279 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 PKR1YMR123W 369 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 SWS2YNL081C 432 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 GYP5YPL249C 2685 nt1.77□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 KAR3YPR141C 2190 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 CHS1YNL192W 3396 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YGR250CYGR250C 2346 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 IRE1YHR079C 3348 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 CTR9YOL145C 3234 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 SNF5YBR289W 2718 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 PEP3YLR148W 2757 nt1.76□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.75□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YGR283CYGR283C 1026 nt1.75□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YKL123WYKL123W 381 nt1.75□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 TIF11YMR260C 462 nt1.75□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YBL083CYBL083C 426 nt1.75□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 COX1Q0045 1605 nt1.75□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 VPS52YDR484W 1926 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 IRC19YLL033W 693 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 BER1YLR412W 825 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YBR224WYBR224W 516 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 SLM6YBR266C 453 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 MEC1YBR136W 7107 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 SPR3YGR059W 1539 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YOR019WYOR019W 2193 nt1.74□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YSW1YBR148W 1830 nt1.73□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 RBK1YCR036W 1002 nt1.73□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YDL041WYDL041W 354 nt1.73□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 DAD4YDR320C-A 219 nt1.73□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.73□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 FIG2YCR089W 4830 nt1.73□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 SPO24YPR036W-A 204 nt1.72□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 MDM20YOL076W 2391 nt1.72□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 IRR1YIL026C 3453 nt1.72□□□□□ -2.13
NFI1Q12216 YJR098CYJR098C 1971 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 MET32YDR253C 576 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 SMB1YER029C 591 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 TRX1YLR043C 312 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YBR184WYBR184W 1572 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 SKI3YPR189W 4299 nt1.71□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 KCS1YDR017C 3153 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YGL024WYGL024W 336 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 RPC10YHR143W-A 213 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 VPS34YLR240W 2628 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 RBL2YOR265W 321 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 SWT1YOR166C 1377 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 CTF4YPR135W 2784 nt1.7□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.69□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 snR79snR79 84 nt1.69□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 CGI121YML036W 546 nt1.69□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YBL073WYBL073W 312 nt1.69□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 IRC20YLR247C 4671 nt1.69□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 IRA1YBR140C 9279 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 RPL31AYDL075W 342 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 COX7YMR256C 183 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 CMC2YBL059C-A 330 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YOR248WYOR248W 303 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 FMP23YBR047W 528 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 SVS1YPL163C 783 nt1.68□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 HIR3YJR140C 4947 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 LYS9YNR050C 1341 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 PET127YOR017W 2403 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 MSC6YOR354C 2079 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YER121WYER121W 345 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 MCM22YJR135C 720 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YKL044WYKL044W 321 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YOR392WYOR392W 444 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 FYV8YGR196C 2454 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 FRK1YPL141C 2598 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 RLM1YPL089C 2031 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 HMI1YOL095C 2121 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 ASM4YDL088C 1587 nt1.67□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 SSK2YNR031C 4740 nt1.66□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.66□□□□□ -2.14
NFI1Q12216 YJR079WYJR079W 330 nt1.65□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 RPS18BYML026C 441 nt1.65□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 PIK1YNL267W 3201 nt1.65□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 MSS11YMR164C 2277 nt1.65□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YDL032WYDL032W 312 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 snR84snR84 550 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 CRG1YHR209W 876 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 ILM1YJR118C 612 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YJR141WYJR141W 1044 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YAR068WYAR068W 486 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 TMA10YLR327C 261 nt1.64□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 CDC24YAL041W 2565 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 SPC110YDR356W 2835 nt1.63□□□□□ -2.15
NFI1Q12216 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.63□□□□□ -2.15
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