Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 TDA9YML081W 3756 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 HER1YOR227W 3741 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 SHE9YDR393W 1371 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 STB4YMR019W 2850 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 MGA2YIR033W 3342 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YDL118WYDL118W 381 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 IES5YER092W 378 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 TEN1YLR010C 483 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YBL012CYBL012C 402 nt1.99□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 FKS1YLR342W 5631 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 TMA7YLR262C-A 195 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 NOP15YNL110C 663 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YMR045CYMR045C 5268 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 MUD2YKL074C 1584 nt1.98□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 RNH70YGR276C 1662 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 CAT2YML042W 2013 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YER121WYER121W 345 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YGL069CYGL069C 465 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 LSO2YGR169C-A 279 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 COX7YMR256C 183 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 PGA1YNL158W 597 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 ATP19YOL077W-A 207 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 GPX2YBR244W 489 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 SGD1YLR336C 2700 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 AGC1YPR021C 2709 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 SYH1YPL105C 2550 nt1.97□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 PEP1YBL017C 4740 nt1.96□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YDR341CYDR341C 1824 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 RPL37BYDR500C 267 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 RPA34YJL148W 702 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YAR068WYAR068W 486 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YML084WYML084W 309 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YPR039WYPR039W 336 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 KAR3YPR141C 2190 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 CDC24YAL041W 2565 nt1.96□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YLR149CYLR149C 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 PPN1YDR452W 2025 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 COX13YGL191W 390 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 SPC29YPL124W 762 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 CFT2YLR115W 2580 nt1.95□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 HSK3YKL138C-A 210 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 PEX8YGR077C 1770 nt1.94□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 ASM4YDL088C 1587 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 DIS3YOL021C 3006 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YDL062WYDL062W 426 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 snR79snR79 84 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 ATP17YDR377W 306 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 FYV7YLR068W 456 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 RPS18BYML026C 441 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 CYB5YNL111C 363 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 UBR2YLR024C 5619 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 RPH1YER169W 2391 nt1.93□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 BI2Q0110 1272 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 PRE4YFR050C 801 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YLR171WYLR171W 390 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YML108WYML108W 318 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 DDR48YMR173W 1293 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 snR13snR13 124 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YOR392WYOR392W 444 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.92□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 NAM7YMR080C 2916 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 FAB1YFR019W 6837 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 HCS1YKL017C 2052 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 NOT5YPR072W 1683 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YCR001WYCR001W 315 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 YLR255CYLR255C 354 nt1.91□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 PLC1YPL268W 2610 nt1.9□□□□□ -2.1
VPS54Q12071 FCF2YLR051C 654 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YLR202CYLR202C 327 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 PET123YOR158W 957 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 GAL7YBR018C 1101 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YPL068CYPL068C 882 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 ARP7YPR034W 1434 nt1.9□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YGL024WYGL024W 336 nt1.89□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YGR025WYGR025W 303 nt1.89□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YHR125WYHR125W 306 nt1.89□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YLR456WYLR456W 615 nt1.89□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 PET309YLR067C 2898 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 IRR1YIL026C 3453 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 MNL2YLR057W 2550 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 YCR043CYCR043C 384 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 HUR1YGL168W 333 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 VMR1YHL035C 4779 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 ZRG8YER033C 3231 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 MSS11YMR164C 2277 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 DFG16YOR030W 1860 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 ADR1YDR216W 3972 nt1.88□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 TMA22YJR014W 597 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 AIM29YKR074W 468 nt1.87□□□□□ -2.11
VPS54Q12071 SYM1YLR251W 594 nt1.87□□□□□ -2.11
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