Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 MTC7YEL033W 420 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YOL159CYOL159C 516 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 GPX2YBR244W 489 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 IRR1YIL026C 3453 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YER121WYER121W 345 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 RTT102YGR275W 474 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 VPS55YJR044C 423 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 RPC25YKL144C 639 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 COF1YLL050C 432 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YNL226WYNL226W 411 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 ROX1YPR065W 1107 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 UBS1YBR165W 834 nt0.92□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 SIP4YJL089W 2490 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YDR115WYDR115W 318 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 BNA7YDR428C 786 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 SMC4YLR086W 4257 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YLR149CYLR149C 2193 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 SLS1YLR139C 1932 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 ROM2YLR371W 4071 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 TTI1YKL033W 3117 nt0.91□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.9□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.9□□□□□ -2.26
YHP1Q04116 MDS3YGL197W 4464 nt0.9□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 snR59snR59 78 nt0.9□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 RTR2YDR066C 591 nt0.9□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.9□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 RPS7BYNL096C 573 nt0.9□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YBR224WYBR224W 516 nt0.9□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 MVP1YMR004W 1536 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 TDA2YER071C 381 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 LSO2YGR169C-A 279 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 LAG1YHL003C 1236 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 DFG10YIL049W 762 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YMR324CYMR324C 243 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SPT7YBR081C 3999 nt0.89□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 AZF1YOR113W 2745 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 VMA7YGR020C 357 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 COX3Q0275 810 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 FCF2YLR051C 654 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 GAL7YBR018C 1101 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YPR147CYPR147C 915 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YSY6YBR162W-A 198 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 DPB11YJL090C 2295 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 DGR2YKL121W 2559 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 VAM6YDL077C 3150 nt0.88□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SNF5YBR289W 2718 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 IRC2YDR112W 309 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 TIM8YJR135W-A 264 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 ARV1YLR242C 966 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 URA10YMR271C 684 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 NOP15YNL110C 663 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SAG1YJR004C 1953 nt0.87□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SHE4YOR035C 2370 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 NUP82YJL061W 2142 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 APL1YJR005W 2103 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 PEP3YLR148W 2757 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 CWC23YGL128C 852 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 FSH1YHR049W 732 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SMD3YLR147C 306 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SEC22YLR268W 645 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 CGI121YML036W 546 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 CTK3YML112W 891 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YOR376WYOR376W 369 nt0.86□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 MAK10YEL053C 2202 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SMY1YKL079W 1971 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SGD1YLR336C 2700 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SEC5YDR166C 2916 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 LIN1YHR156C 1023 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 RPL34BYIL052C 366 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 ACF4YJR083C 930 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YLR217WYLR217W 324 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YOL106WYOL106W 354 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SEF1YBL066C 3447 nt0.85□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 KAR3YPR141C 2190 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 BEM2YER155C 6504 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YDL068WYDL068W 330 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SNO3YFL060C 669 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 SNO2YNL334C 669 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 HHT1YBR010W 411 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 YPR063CYPR063C 423 nt0.84□□□□□ -2.27
YHP1Q04116 OSH6YKR003W 1347 nt0.84□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YCS4YLR272C 3531 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 NUP188YML103C 4968 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YFR057WYFR057W 456 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.6 ms