Protein–RNA interactions for Protein: Q00578

SSL2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSL2Q00578 MSS11YMR164C 2277 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YDL211CYDL211C 1119 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 RPS17BYDR447C 411 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 ABF2YMR072W 552 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 RPL32YBL092W 393 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 SEC26YDR238C 2922 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 ARP7YPR034W 1434 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 GIN4YDR507C 3429 nt2.83□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 FIR1YER032W 2631 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 SKT5YBL061C 2091 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 APQ12YIL040W 417 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 CCW14YLR390W-A 717 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YPL182CYPL182C 384 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 snR49snR49 165 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 STE11YLR362W 2154 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 ORC1YML065W 2745 nt2.82□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YMR31YFR049W 372 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 PAM16YJL104W 450 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 SDH2YLL041C 801 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YPR146CYPR146C 330 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YCL023CYCL023C 348 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 REV1YOR346W 2958 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 BCK1YJL095W 4437 nt2.81□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 MLH1YMR167W 2310 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 SSE1YPL106C 2082 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 AIM9YER080W 1884 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 VPS64YDR200C 1815 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YDR048CYDR048C 315 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YER121WYER121W 345 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 COX14YML129C 213 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 DAD3YBR233W-A 285 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 LEU3YLR451W 2661 nt2.8□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 RPL40AYIL148W 387 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 PFD1YJL179W 330 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 HTB2YBL002W 396 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YOL160WYOL160W 342 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 NFT1YKR103W 3657 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 RAD61YDR014W 1944 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 DBP6YNR038W 1890 nt2.79□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 DNL4YOR005C 2835 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 ESC1YMR219W 4977 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 snR76snR76 109 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YFH1YDL120W 525 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 HSK3YKL138C-A 210 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YMR324CYMR324C 243 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 TRM7YBR061C 933 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 YIL166CYIL166C 1629 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 HCS1YKL017C 2052 nt2.78□□□□□ -1.96
SSL2Q00578 UTP14YML093W 2700 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 GEA1YJR031C 4227 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 ISD11YER048W-A 285 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YJL182CYJL182C 318 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 KTI11YBL071W-A 249 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 CRS5YOR031W 210 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 IES4YOR189W 351 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 ECM25YJL201W 1800 nt2.77□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YGL239CYGL239C 315 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 TIM13YGR181W 318 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YIL102CYIL102C 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 COA4YLR218C 453 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YBT1YLL048C 4986 nt2.76□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YBR064WYBR064W 429 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 PUF4YGL014W 2667 nt2.75□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 ASG1YIL130W 2895 nt2.74□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 SVL3YPL032C 2478 nt2.74□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.74□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 SUL1YBR294W 2580 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 TCB2YNL087W 3537 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 SLH1YGR271W 5904 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 AYR1YIL124W 894 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 LCL2YLR104W 396 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 RPL25YOL127W 429 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.73□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 NPR2YEL062W 1848 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 PSO2YMR137C 1986 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 QCR7YDR529C 384 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 LSO2YGR169C-A 279 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YIL032CYIL032C 357 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 NUP120YKL057C 3114 nt2.72□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 MSB1YOR188W 3414 nt2.71□□□□□ -1.97
SSL2Q00578 RPO41YFL036W 4056 nt2.71□□□□□ -1.98
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