Protein–RNA interactions for Protein: P47050

RTT101, Cullin-8, yeastyeast

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT101P47050 YER189WYER189W 369 nt2.25□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.25□□□□□ -2.05
RTT101P47050 RNP1YLL046C 750 nt2.25□□□□□ -2.05
RTT101P47050 CLN3YAL040C 1743 nt2.25□□□□□ -2.05
RTT101P47050 ASG1YIL130W 2895 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YDL041WYDL041W 354 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YFH1YDL120W 525 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 GCN4YEL009C 846 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YLR458WYLR458W 381 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YSY6YBR162W-A 198 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 ATG11YPR049C 3537 nt2.24□□□□□ -2.05
RTT101P47050 RPL40AYIL148W 387 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 RGM1YMR182C 636 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YPL238CYPL238C 390 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 DAD3YBR233W-A 285 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 MGR1YCL044C 1254 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 SWA2YDR320C 2007 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 TFC3YAL001C 3483 nt2.23□□□□□ -2.05
RTT101P47050 UBP1YDL122W 2430 nt2.22□□□□□ -2.05
RTT101P47050 IRC8YJL051W 2469 nt2.22□□□□□ -2.05
RTT101P47050 snR76snR76 109 nt2.22□□□□□ -2.05
RTT101P47050 RAM2YKL019W 951 nt2.22□□□□□ -2.05
RTT101P47050 MRPL31YKL138C 396 nt2.22□□□□□ -2.05
RTT101P47050 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.22□□□□□ -2.05
RTT101P47050 IRC10YOL015W 1761 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 CAJ1YER048C 1176 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 BRP1YGL007W 378 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YKL136WYKL136W 399 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 ALK2YBL009W 2031 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 RPL36AYMR194W 303 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 VTI1YMR197C 654 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YBR197CYBR197C 654 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 MSS11YMR164C 2277 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 SSQ1YLR369W 1974 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 SDC25YLL016W 3147 nt2.21□□□□□ -2.06
RTT101P47050 snR79snR79 84 nt2.2□□□□□ -2.06
RTT101P47050 RPL27BYDR471W 411 nt2.2□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YGR050CYGR050C 357 nt2.2□□□□□ -2.06
RTT101P47050 CRS5YOR031W 210 nt2.2□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YOR199WYOR199W 330 nt2.2□□□□□ -2.06
RTT101P47050 BAS1YKR099W 2436 nt2.2□□□□□ -2.06
RTT101P47050 TOF1YNL273W 3717 nt2.19□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.19□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YMR324CYMR324C 243 nt2.19□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.19□□□□□ -2.06
RTT101P47050 HOS4YIL112W 3252 nt2.19□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YJR003CYJR003C 1560 nt2.19□□□□□ -2.06
RTT101P47050 EDS1YBR033W 2760 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 BNI1YNL271C 5862 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 MGM1YOR211C 2646 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 SAP185YJL098W 3177 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 TMA22YJR014W 597 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YNL018CYNL018C 1839 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 NOP14YDL148C 2433 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 RRP12YPL012W 3687 nt2.18□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YPR097WYPR097W 3222 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 REV3YPL167C 4515 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 TAE2YPL009C 3117 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 TIM9YEL020W-A 264 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 ABM1YJR108W 372 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 LCL2YLR104W 396 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YAF9YNL107W 681 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YCL023CYCL023C 348 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 CDC24YAL041W 2565 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 UFD4YKL010C 4452 nt2.17□□□□□ -2.06
RTT101P47050 EMP24YGL200C 612 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YJL202CYJL202C 348 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 ROX1YPR065W 1107 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 YPR146CYPR146C 330 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 VMA9YCL005W-A 222 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 AFI1YOR129C 2682 nt2.16□□□□□ -2.06
RTT101P47050 RGA1YOR127W 3024 nt2.15□□□□□ -2.06
RTT101P47050 SWT1YOR166C 1377 nt2.15□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YKL118WYKL118W 312 nt2.15□□□□□ -2.07
RTT101P47050 RPS18BYML026C 441 nt2.15□□□□□ -2.07
RTT101P47050 LSM7YNL147W 348 nt2.15□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YFR016CYFR016C 3702 nt2.15□□□□□ -2.07
RTT101P47050 KOG1YHR186C 4674 nt2.15□□□□□ -2.07
RTT101P47050 BRE1YDL074C 2103 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 HRD3YLR207W 2502 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 STH1YIL126W 4080 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 GYP5YPL249C 2685 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 WIP1YDR374W-A 270 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 MZM1YDR493W 372 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 LSO2YGR169C-A 279 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 MSL1YIR009W 336 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YAR053WYAR053W 297 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YMR320WYMR320W 306 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 RPL9BYNL067W 576 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 KSP1YHR082C 3090 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YPR089WYPR089W 2667 nt2.14□□□□□ -2.07
RTT101P47050 CDC50YCR094W 1176 nt2.13□□□□□ -2.07
RTT101P47050 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.13□□□□□ -2.07
RTT101P47050 NHP2YDL208W 471 nt2.13□□□□□ -2.07
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