Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 SWT1YOR166C 1377 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YDL016CYDL016C 303 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YDL041WYDL041W 354 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YDR250CYDR250C 276 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 MRPL44YMR225C 297 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 ZRG8YER033C 3231 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC28P40509 ATG11YPR049C 3537 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 PRM8YGL053W 714 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 RPC10YHR143W-A 213 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YHR210CYHR210C 1026 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YJR141WYJR141W 1044 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YKL044WYKL044W 321 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YNR025CYNR025C 360 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SLM1YIL105C 2061 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 PKH3YDR466W 2697 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SEY1YOR165W 2331 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 DAS1YJL149W 1992 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC28P40509 MET32YDR253C 576 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YBL083CYBL083C 426 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SLM6YBR266C 453 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC28P40509 TBS1YBR150C 3285 nt1.84□□□□□ -2.12
SEC28P40509 MEC1YBR136W 7107 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 RTP1YMR185W 2946 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YCR043CYCR043C 384 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 PAU3YCR104W 375 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 snR84snR84 550 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YDR029WYDR029W 315 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 ILM1YJR118C 612 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 SVS1YPL163C 783 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YBR224WYBR224W 516 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 LYS9YNR050C 1341 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YJR079WYJR079W 330 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 TIF11YMR260C 462 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YOR392WYOR392W 444 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 MEI5YPL121C 669 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC28P40509 PEP3YLR148W 2757 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 SMY1YKL079W 1971 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 IRC20YLR247C 4671 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 TFC8YPL007C 1767 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 RBK1YCR036W 1002 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 SMB1YER029C 591 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 UBX4YMR067C 1251 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 PKR1YMR123W 369 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC28P40509 DNF3YMR162C 4971 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 MSH6YDR097C 3729 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 snR79snR79 84 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 COX7YMR256C 183 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC28P40509 SAR1YPL218W 573 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC28P40509 NOP53YPL146C 1368 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC28P40509 ADR1YDR216W 3972 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YER121WYER121W 345 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC28P40509 CIC1YHR052W 1131 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC28P40509 IRC16YPR038W 360 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC28P40509 YGR250CYGR250C 2346 nt1.78□□□□□ -2.13
SEC28P40509 HIR3YJR140C 4947 nt1.78□□□□□ -2.13
SEC28P40509 SNF5YBR289W 2718 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC28P40509 EMC4YGL231C 573 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC28P40509 RCN2YOR220W 798 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC28P40509 PEX8YGR077C 1770 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC28P40509 IRA1YBR140C 9279 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC28P40509 IRE1YHR079C 3348 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YGL024WYGL024W 336 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YOR248WYOR248W 303 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YCL023CYCL023C 348 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 CDC24YAL041W 2565 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 MDM20YOL076W 2391 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC28P40509 SNU56YDR240C 1479 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 CTR9YOL145C 3234 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 CGI121YML036W 546 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 CTK3YML112W 891 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 CMC2YBL059C-A 330 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 VPS15YBR097W 4365 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 YBR184WYBR184W 1572 nt1.75□□□□□ -2.13
SEC28P40509 RPL31AYDL075W 342 nt1.74□□□□□ -2.13
SEC28P40509 TRX1YLR043C 312 nt1.74□□□□□ -2.13
SEC28P40509 MSS11YMR164C 2277 nt1.74□□□□□ -2.13
SEC28P40509 MSC6YOR354C 2079 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 ASM4YDL088C 1587 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 IRR1YIL026C 3453 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 PPN1YDR452W 2025 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 PET123YOR158W 957 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 snR189snR189 189 nt1.73□□□□□ -2.13
SEC28P40509 PHR1YOR386W 1698 nt1.73□□□□□ -2.13
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