Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 ERP4YOR016C 624 nt2.31□□□□□ -2.04
UBP11P36026 RRP6YOR001W 2202 nt2.31□□□□□ -2.04
UBP11P36026 SPO23YBR250W 1572 nt2.31□□□□□ -2.04
UBP11P36026 NIC96YFR002W 2520 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 HMRA1YCR097W 381 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 YDR157WYDR157W 402 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 RRF1YHR038W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 GRX8YLR364W 330 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 YSW1YBR148W 1830 nt2.3□□□□□ -2.04
UBP11P36026 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 NOP10YHR072W-A 177 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 VTI1YMR197C 654 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 YPR012WYPR012W 255 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 VMA9YCL005W-A 222 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 TAE2YPL009C 3117 nt2.29□□□□□ -2.04
UBP11P36026 SAP185YJL098W 3177 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 SPC72YAL047C 1869 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 RGA1YOR127W 3024 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 BFA1YJR053W 1725 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 SMD1YGR074W 441 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 MSL1YIR009W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 ZEO1YOL109W 342 nt2.28□□□□□ -2.04
UBP11P36026 REV3YPL167C 4515 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 GYP5YPL249C 2685 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SWT1YOR166C 1377 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YER079WYER079W 633 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SNC1YAL030W 354 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 COX7YMR256C 183 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 LEE1YPL054W 906 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 IRC10YOL015W 1761 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SSD1YDR293C 3753 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 CDC24YAL041W 2565 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 RAV1YJR033C 4074 nt2.27□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SIR4YDR227W 4077 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 CDC53YDL132W 2448 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 CDC50YCR094W 1176 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YHR138CYHR138C 345 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 CRG1YHR209W 876 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 CDC33YOL139C 642 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YOL159CYOL159C 516 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 MET18YIL128W 3099 nt2.26□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YER121WYER121W 345 nt2.25□□□□□ -2.05
UBP11P36026 RPS18BYML026C 441 nt2.25□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YMR324CYMR324C 243 nt2.25□□□□□ -2.05
UBP11P36026 KAP123YER110C 3342 nt2.25□□□□□ -2.05
UBP11P36026 VPS35YJL154C 2835 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 BNI1YNL271C 5862 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 IRC8YJL051W 2469 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 ATP6Q0085 780 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 NFU1YKL040C 771 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SEC22YLR268W 645 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 DGR1YNL130C-A 147 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 COX1Q0045 1605 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YOL098CYOL098C 3114 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 MKT1YNL085W 2493 nt2.24□□□□□ -2.05
UBP11P36026 BRE1YDL074C 2103 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 STH1YIL126W 4080 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 snR79snR79 84 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SEC31YDL195W 3822 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 TMA22YJR014W 597 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 DIE2YGR227W 1578 nt2.23□□□□□ -2.05
UBP11P36026 SPO22YIL073C 2928 nt2.22□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YDR269CYDR269C 324 nt2.22□□□□□ -2.05
UBP11P36026 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.22□□□□□ -2.05
UBP11P36026 MCD1YDL003W 1701 nt2.22□□□□□ -2.05
UBP11P36026 GIP3YPL137C 3831 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 SDH7YDR511W 402 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 FCF2YLR051C 654 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 MRPL50YNR022C 420 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YOR053WYOR053W 342 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 SNC2YOR327C 348 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 RTC6YPL183W-A 282 nt2.21□□□□□ -2.06
UBP11P36026 MSS11YMR164C 2277 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 RPL27BYDR471W 411 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 URM1YIL008W 300 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 RPS24BYIL069C 408 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YLR255CYLR255C 354 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 UBC7YMR022W 498 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YOR333CYOR333C 417 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YPL185WYPL185W 396 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 SPP41YDR464W 4308 nt2.2□□□□□ -2.06
UBP11P36026 snR56snR56 88 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 LSO2YGR169C-A 279 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YML084WYML084W 309 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 CRM1YGR218W 3255 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 COS111YBR203W 2775 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 KAR3YPR141C 2190 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 SGD1YLR336C 2700 nt2.19□□□□□ -2.06
UBP11P36026 VPS8YAL002W 3825 nt2.18□□□□□ -2.06
UBP11P36026 PEP1YBL017C 4740 nt2.18□□□□□ -2.06
UBP11P36026 SWF1YDR126W 1011 nt2.18□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.18□□□□□ -2.06
UBP11P36026 YLR287CYLR287C 1068 nt2.18□□□□□ -2.06
UBP11P36026 RTT107YHR154W 3213 nt2.17□□□□□ -2.06
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