Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa10P31310 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms