Protein–RNA interactions for Protein: P25384

TY2B-C, Transposon Ty2-C Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-CP25384 TAD1YGL243W 1203 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YIL141WYIL141W 390 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YMR099CYMR099C 894 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 snR13snR13 124 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 VMA7YGR020C 357 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 UPF3YGR072W 1164 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 FYV4YHR059W 393 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 PSO2YMR137C 1986 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 AHC2YCR082W 387 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YLL020CYLL020C 306 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 HHT1YBR010W 411 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 RPS10AYOR293W 318 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 ALG5YPL227C 1005 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 PEX34YCL056C 435 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YDL157CYDL157C 357 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 IRC19YLL033W 693 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YNL226WYNL226W 411 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 FIG1YBR040W 897 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 DAS1YJL149W 1992 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 snR68snR68 136 nt0.18□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 FAR7YFR008W 666 nt0.18□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YOR053WYOR053W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YGL109WYGL109W 324 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 REX3YLR107W 1215 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 MRPL50YNR022C 420 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 NUT1YGL151W 3399 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 BFR1YOR198C 1413 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 MGR1YCL044C 1254 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 TCA17YEL048C 459 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 SPC2YML055W 537 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 MSC6YOR354C 2079 nt0.15□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 UTP10YJL109C 5310 nt0.15□□□□□ -2.38
TY2B-CP25384 EMC5YIL027C 426 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 RPS24BYIL069C 408 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 YIR020CYIR020C 303 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 GMC2YLR445W 567 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 CIN2YPL241C 807 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 SGO1YOR073W 1773 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 HDA3YPR179C 1968 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 KEG1YFR042W 603 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 GDS1YOR355W 1569 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 GIC1YHR061C 945 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 ARL3YPL051W 597 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 ULI1YFR026C 510 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 RPL40BYKR094C 387 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 TSA2YDR453C 591 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 RTR1YER139C 681 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 snR35snR35 204 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 GLG1YKR058W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 SMD1YGR074W 441 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 NOP10YHR072W-A 177 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 NBP1YLR457C 960 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 SLX4YLR135W 2247 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 YFR054CYFR054C 579 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 DUO1YGL061C 744 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 RPI1YIL119C 1224 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 ABF2YMR072W 552 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 MXR1YER042W 555 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 LAG1YHL003C 1236 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 HAL9YOL089C 3093 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-CP25384 SDL1YIL167W 633 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YMR324CYMR324C 243 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 IES4YOR189W 351 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 PXA2YKL188C 2562 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 FUS2YMR232W 2034 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 NUP120YKL057C 3114 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 RAM2YKL019W 951 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 TIF11YMR260C 462 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 LTO1YNL260C 597 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 ENV11YGR071C 2583 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YDL206WYDL206W 2289 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YOL050CYOL050C 321 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 LOA1YPR139C 903 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 BFA1YJR053W 1725 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 RSM28YDR494W 1086 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 AFR1YDR085C 1863 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 VIK1YPL253C 1944 nt0.05□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 MDM36YPR083W 1740 nt0.05□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 AI3Q0060 1248 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YGL217CYGL217C 342 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 NIP100YPL174C 2607 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 SEC5YDR166C 2916 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 BMT5YIL096C 1011 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 HSK3YKL138C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 RPL32YBL092W 393 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 MIX23YBL107C 591 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-CP25384 SPO77YLR341W 1434 nt0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 143.8 ms