Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc1Q9QZF2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc1Q9QZF2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms