Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms