Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp4Q99ME9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp4Q99ME9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms