Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms