Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot1Q6ZQ08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms