Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Flrt1Q6RKD8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Flrt1Q6RKD8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms