Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q547

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit NOP10, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP10Q6Q547 SHE4YOR035C 2370 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YGL039WYGL039W 1047 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YGL217CYGL217C 342 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 SMD1YGR074W 441 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 ECM12YHR021W-A 456 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YAL069WYAL069W 315 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 MGR1YCL044C 1254 nt0.18□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 EDC1YGL222C 528 nt0.17□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 TMA22YJR014W 597 nt0.17□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.17□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YET2YMR040W 483 nt0.17□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 YBR090CYBR090C 369 nt0.17□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 ECM25YJL201W 1800 nt0.17□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 MXR1YER042W 555 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 FIP1YJR093C 984 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 RCN1YKL159C 636 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 RRT16YNL105W 429 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 PEX15YOL044W 1152 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 PAN2YGL094C 3348 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 NCS2YNL119W 1482 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP10Q6Q547 RSM28YDR494W 1086 nt0.15□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.15□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 RIF2YLR453C 1188 nt0.15□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PGA1YNL158W 597 nt0.15□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YDL073WYDL073W 2955 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SNA4YDL123W 423 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 LAG1YHL003C 1236 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 BMT5YIL096C 1011 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 VPS25YJR102C 609 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YLR402WYLR402W 192 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SPC2YML055W 537 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YNL089CYNL089C 477 nt0.14□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SPT21YMR179W 2277 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PIP2YOR363C 2991 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 TOF2YKR010C 2316 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YGL109WYGL109W 324 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 ABF2YMR072W 552 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 EAF7YNL136W 1278 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YBL094CYBL094C 333 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YHL012WYHL012W 1482 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PAC1YOR269W 1485 nt0.13□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 LTE1YAL024C 4308 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SNU23YDL098C 585 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 MVB12YGR206W 306 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 URM1YIL008W 300 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 RAM2YKL019W 951 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 RPL9BYNL067W 576 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 UFE1YOR075W 1041 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 CDC27YBL084C 2277 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 NDD1YOR372C 1665 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SHE9YDR393W 1371 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SST2YLR452C 2097 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SWF1YDR126W 1011 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YGR219WYGR219W 342 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 ABM1YJR108W 372 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PPN1YDR452W 2025 nt0.11□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PRS3YHL011C 963 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SDL1YIL167W 633 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PAM16YJL104W 450 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 RPC25YKL144C 639 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 SHG1YBR258C 429 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 MUD2YKL074C 1584 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP10Q6Q547 PAU12YGR294W 363 nt0.09□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 TAP42YMR028W 1101 nt0.09□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YOR218CYOR218C 420 nt0.09□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 PIG1YLR273C 1947 nt0.09□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 TRS65YGR166W 1683 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 RTT102YGR275W 474 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YNL235CYNL235C 432 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YBL108WYBL108W 306 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YPL034WYPL034W 498 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 FMP23YBR047W 528 nt0.08□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YDL206WYDL206W 2289 nt0.07□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YDR199WYDR199W 366 nt0.07□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 CAJ1YER048C 1176 nt0.07□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 MAM1YER106W 909 nt0.07□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 ECI1YLR284C 843 nt0.07□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 BEM3YPL115C 3387 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YCR043CYCR043C 384 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YDL196WYDL196W 330 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 RPS24BYIL069C 408 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 HYM1YKL189W 1200 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YLR225CYLR225C 1224 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 BRX1YOL077C 876 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YJR098CYJR098C 1971 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YJL049WYJL049W 1353 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 PRP16YKR086W 3216 nt0.06□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 GEA2YEL022W 4380 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YPD1YDL235C 504 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 KEG1YFR042W 603 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 OST5YGL226C-A 261 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP10Q6Q547 YAL064WYAL064W 285 nt0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.4 ms