Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prdm10Q3UTQ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms