Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 EMC5YIL027C 426 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YLR311CYLR311C 348 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YBL094CYBL094C 333 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 IRC14YOR135C 342 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YBR090CYBR090C 369 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YLL054CYLL054C 2532 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YPD1YDL235C 504 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 MZM1YDR493W 372 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 GRX7YBR014C 612 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 IRR1YIL026C 3453 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 PIP2YOR363C 2991 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 SWI6YLR182W 2412 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 SST2YLR452C 2097 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 UTP13YLR222C 2454 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 BFA1YJR053W 1725 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 VMA7YGR020C 357 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 PPE1YHR075C 1203 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 SWS2YNL081C 432 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 RAD50YNL250W 3939 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YCS4YLR272C 3531 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 MSC6YOR354C 2079 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YDR248CYDR248C 582 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 HTD2YHR067W 843 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 URM1YIL008W 300 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 RPI1YIL119C 1224 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 HSK3YKL138C-A 210 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 BUD3YCL014W 4911 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 MVB12YGR206W 306 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YMR147WYMR147W 672 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YMR178WYMR178W 825 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YJR003CYJR003C 1560 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 NUP145YGL092W 3954 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SET3YKR029C 2256 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 TIF11YMR260C 462 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 HHT1YBR010W 411 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 TIM18YOR297C 579 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 RIM20YOR275C 1986 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SWT1YOR166C 1377 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 LSM6YDR378C 261 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YIR020CYIR020C 303 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 RPL38YLR325C 237 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 RRP15YPR143W 753 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YAR009CYAR009C 3591 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 UTP10YJL109C 5310 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 LST4YKL176C 2487 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 RTR1YER139C 681 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 HIT1YJR055W 495 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 RAM2YKL019W 951 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 AIM9YER080W 1884 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SWI4YER111C 3282 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YJL049WYJL049W 1353 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YMR160WYMR160W 2451 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 POP8YBL018C 402 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 PAI3YMR174C 207 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 LSM7YNL147W 348 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 PGA1YNL158W 597 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 AIM41YOR215C 558 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YOR218CYOR218C 420 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 RSM28YDR494W 1086 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SMB1YER029C 591 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SMD1YGR074W 441 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SEC22YLR268W 645 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 TAP42YMR028W 1101 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 TEX1YNL253W 1269 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 STB6YKL072W 2301 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT15Q3E811 SDL1YIL167W 633 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 YLR225CYLR225C 1224 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 DIA1YMR316W 1011 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 TSA2YDR453C 591 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 SLX9YGR081C 633 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 LAG1YHL003C 1236 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 MRPL24YMR193W 777 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 YNR068CYNR068C 819 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 CDC27YBL084C 2277 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 PRS3YHL011C 963 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 SPP381YBR152W 876 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 SLX4YLR135W 2247 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT15Q3E811 AI4Q0065 1671 nt0.31□□□□□ -2.36
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