Protein–RNA interactions for Protein: Q12499

NOP58, Nucleolar protein 58, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP58Q12499 LCL2YLR104W 396 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 YOR248WYOR248W 303 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 snR41snR41 95 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 UBR1YGR184C 5853 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 snR70snR70 164 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 YDL118WYDL118W 381 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 FMP16YDR070C 282 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 ECL1YGR146C 636 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 RPB5YBR154C 648 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 MPH1YIR002C 2982 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 YJL016WYJL016W 1686 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP58Q12499 TMN3YER113C 2121 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 snR54snR54 86 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 MSL5YLR116W 1431 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 IPT1YDR072C 1584 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 BRE1YDL074C 2103 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 RRF1YHR038W 693 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YLR269CYLR269C 351 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 GIP3YPL137C 3831 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 ROX1YPR065W 1107 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 ELG1YOR144C 2376 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YJL070CYJL070C 2667 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 CLN3YAL040C 1743 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YDL032WYDL032W 312 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 MZM1YDR493W 372 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 COS111YBR203W 2775 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 BFA1YJR053W 1725 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 RRP6YOR001W 2202 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 VPS52YDR484W 1926 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 RPS24AYER074W 408 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YHR125WYHR125W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 TEN1YLR010C 483 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 GRX8YLR364W 330 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YNL010WYNL010W 726 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 TSC3YBR058C-A 243 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 DNA2YHR164C 4569 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 PPN1YDR452W 2025 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 VOA1YGR106C 798 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 NOP10YHR072W-A 177 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 COX7YMR256C 183 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YPR039WYPR039W 336 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YDL041WYDL041W 354 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YMR324CYMR324C 243 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 snR13snR13 124 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 PDR3YBL005W 2931 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YGR025WYGR025W 303 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 NBL1YHR199C-A 222 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 SNC1YAL030W 354 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YLR101CYLR101C 396 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 YAR068WYAR068W 486 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 GDS1YOR355W 1569 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP58Q12499 IRC10YOL015W 1761 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 SMD1YGR074W 441 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YNL324WYNL324W 396 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 IST2YBR086C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 CDC50YCR094W 1176 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 VTI1YMR197C 654 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 TIF11YMR260C 462 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 CMC2YBL059C-A 330 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 GCN2YDR283C 4980 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 SMC6YLR383W 3345 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 HUR1YGL168W 333 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YGR042WYGR042W 816 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 MSL1YIR009W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 SEC22YLR268W 645 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 CDC33YOL139C 642 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 RTC6YPL183W-A 282 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YPR177CYPR177C 372 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 SWT1YOR166C 1377 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 DIS3YOL021C 3006 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 FKS1YLR342W 5631 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 ATP17YDR377W 306 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 YKL063CYKL063C 504 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 EMC6YLL014W 327 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 TOR2YKL203C 7425 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 SEC31YDL195W 3822 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 SCP160YJL080C 3669 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 NEO1YIL048W 3456 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 CDC53YDL132W 2448 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 snR79snR79 84 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP58Q12499 RPS22BYLR367W 393 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.8 ms