Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 CUP9YPL177C 921 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 snR35snR35 204 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YSW1YBR148W 1830 nt0.59□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 SAS3YBL052C 2496 nt0.59□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 VPS55YJR044C 423 nt0.59□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YCR015CYCR015C 954 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YFR056CYFR056C 369 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YIL012WYIL012W 342 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YOR152CYOR152C 771 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 SLK19YOR195W 2466 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YJL022WYJL022W 309 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YMR147WYMR147W 672 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 AIM41YOR215C 558 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 HIR3YJR140C 4947 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 CTR9YOL145C 3234 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 MTC7YEL033W 420 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 TCA17YEL048C 459 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YAR068WYAR068W 486 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 NSE4YDL105W 1209 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 BTN2YGR142W 1233 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 MRPL24YMR193W 777 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 SNC2YOR327C 348 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 KAR9YPL269W 1935 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YFR054CYFR054C 579 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YPR063CYPR063C 423 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 CUR1YPR158W 759 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 AI3Q0060 1248 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 IES5YER092W 378 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 CMC2YBL059C-A 330 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 MER1YNL210W 813 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 SEC8YPR055W 3198 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 NSE3YDR288W 912 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 NSL1YPL233W 651 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 COG8YML071C 1824 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 PRP39YML046W 1890 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 SMD1YGR074W 441 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-BLQ12490 BFR1YOR198C 1413 nt0.53□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 MDM36YPR083W 1740 nt0.53□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YDR042CYDR042C 603 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YDR286CYDR286C 345 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YNL089CYNL089C 477 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 CSI2YOL007C 1026 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 PEX15YOL044W 1152 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 ARL3YPL051W 597 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 ADF1YCL058W-A 342 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 DGR2YKL121W 2559 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 CDC5YMR001C 2118 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 ALK1YGL021W 2283 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 RAM2YKL019W 951 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 MFA1YDR461W 111 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YAL069WYAL069W 315 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 CYB5YNL111C 363 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 MVP1YMR004W 1536 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YGL177WYGL177W 348 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 RPL40AYIL148W 387 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 PSO2YMR137C 1986 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YDR338CYDR338C 2088 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 HOP2YGL033W 657 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 MRPL40YPL173W 894 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 NOP12YOL041C 1380 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YGR250CYGR250C 2346 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YPR014CYPR014C 330 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 RPB5YBR154C 648 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 SST2YLR452C 2097 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 COX1Q0045 1605 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 CSE1YGL238W 2883 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 AZF1YOR113W 2745 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 RPL35BYDL136W 363 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 CIN2YPL241C 807 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YBR063CYBR063C 1215 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 RGI1YER067W 486 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YNL010WYNL010W 726 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 YNL179CYNL179C 438 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 SFM1YOR021C 642 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BLQ12490 NCA2YPR155C 1851 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 MVB12YGR206W 306 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YIL141WYIL141W 390 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 RIF2YLR453C 1188 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 LSM7YNL147W 348 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 TEX1YNL253W 1269 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 RRT16YNL105W 429 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 SPP381YBR152W 876 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 MGR1YCL044C 1254 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 FUS2YMR232W 2034 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 MUK1YPL070W 1839 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BLQ12490 UFE1YOR075W 1041 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.7 ms