Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 RTT10YPL183C 3042 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 COG3YER157W 2406 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 SSN2YDR443C 4263 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 HMRA2YCR096C 360 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 CAJ1YER048C 1176 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 MSL1YIR009W 336 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 PGA1YNL158W 597 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 snR43snR43 209 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 ISW1YBR245C 3390 nt3.01□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 INP52YNL106C 3552 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 GCN4YEL009C 846 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YER023C-AYER023C-A 213 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 NCE101YJL205C 162 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 BIL1YOR304C-A 231 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YNL034WYNL034W 1839 nt3□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 MMS1YPR164W 4224 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 RLF2YPR018W 1821 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YFR056CYFR056C 369 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YIL174WYIL174W 228 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 SHE2YKL130C 741 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 COX7YMR256C 183 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 COX1Q0045 1605 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 GCV2YMR189W 3105 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 NAB3YPL190C 2409 nt2.99□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 NPR1YNL183C 2373 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 VPS41YDR080W 2979 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 AIM32YML050W 936 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 MRPL33YMR286W 261 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 STE5YDR103W 2754 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 TOP2YNL088W 4287 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 ECM29YHL030W 5607 nt2.98□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 FIR1YER032W 2631 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 NEW1YPL226W 3591 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YLR031WYLR031W 561 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YMR320WYMR320W 306 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 ACM1YPL267W 630 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 CDC20YGL116W 1833 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 AXL1YPR122W 3627 nt2.97□□□□□ -1.93
CLF1Q12309 YSW1YBR148W 1830 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YBT1YLL048C 4986 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 HOP2YGL033W 657 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 RPL26AYLR344W 384 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 ESF2YNR054C 951 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 LCL1YPL056C 306 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 TPS2YDR074W 2691 nt2.96□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YGR067CYGR067C 2415 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 WIP1YDR374W-A 270 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 PNC1YGL037C 651 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 RPL14BYHL001W 417 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 RPS22AYJL190C 393 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YBL073WYBL073W 312 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 PDR1YGL013C 3207 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 VPS52YDR484W 1926 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 NUP82YJL061W 2142 nt2.95□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YKU80YMR106C 1890 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 DNL4YOR005C 2835 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 NPR3YHL023C 3441 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 PUF4YGL014W 2667 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YBP1YBR216C 2025 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 HYP2YEL034W 474 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 EMC6YLL014W 327 nt2.94□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 SGM1YJR134C 2124 nt2.93□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 SMY2YBR172C 2223 nt2.93□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.93□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 IRC23YOR044W 474 nt2.93□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YJL181WYJL181W 1836 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YDL041WYDL041W 354 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 snR76snR76 109 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 ADK1YDR226W 669 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YER189WYER189W 369 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YIL058WYIL058W 285 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 MCM22YJR135C 720 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 ISF1YMR081C 1017 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 PSK2YOL045W 3306 nt2.92□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 SSY1YDR160W 2559 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 RPS17BYDR447C 411 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 HYR1YIR037W 492 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 TMA22YJR014W 597 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 FPR1YNL135C 345 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 ECM5YMR176W 4236 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 SEC7YDR170C 6030 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 SAK1YER129W 3429 nt2.9□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 PCF11YDR228C 1881 nt2.9□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 ORC2YBR060C 1863 nt2.9□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 YPK1YKL126W 2043 nt2.9□□□□□ -1.94
CLF1Q12309 NUM1YDR150W 8247 nt2.9□□□□□ -1.95
CLF1Q12309 YJL016WYJL016W 1686 nt2.9□□□□□ -1.95
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