Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SUP56tL(CAA)A 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SUP53tL(CAA)C 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SUP54tL(CAA)G2 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 EMC6YLL014W 327 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SEC22YLR268W 645 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 RRT1YBL048W 312 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YBR032WYBR032W 303 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 VPS64YDR200C 1815 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 IRC8YJL051W 2469 nt1.95□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 CLN3YAL040C 1743 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 COS111YBR203W 2775 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 DNF1YER166W 4716 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 ATP17YDR377W 306 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 VMR1YHL035C 4779 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 COX1Q0045 1605 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 MCD1YDL003W 1701 nt1.94□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 CHC1YGL206C 4962 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 KAR3YPR141C 2190 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 NIC96YFR002W 2520 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YPL150WYPL150W 2706 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 RPL27BYDR471W 411 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 HMF1YER057C 390 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 ERP6YGL002W 651 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YKL202WYKL202W 582 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YML037CYML037C 1023 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 VPS35YJL154C 2835 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SPO22YIL073C 2928 nt1.93□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YMR045CYMR045C 5268 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YER135CYER135C 393 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 RRF1YHR038W 693 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 MSL1YIR009W 336 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YKL066WYKL066W 444 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SCP160YJL080C 3669 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 IST2YBR086C 2841 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 MSS11YMR164C 2277 nt1.92□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 CDC24YAL041W 2565 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SOK2YMR016C 2358 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YDR114CYDR114C 303 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 PAU10YDR542W 363 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YFL019CYFL019C 354 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 PAU11YGL261C 363 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YKL063CYKL063C 504 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 PAU4YLR461W 363 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SNC2YOR327C 348 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 YOR333CYOR333C 417 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SIR4YDR227W 4077 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 STE11YLR362W 2154 nt1.91□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 SAP185YJL098W 3177 nt1.9□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 CDC53YDL132W 2448 nt1.9□□□□□ -2.1
TPT1Q12272 PDR1YGL013C 3207 nt1.9□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 HOP2YGL033W 657 nt1.9□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 NFU1YKL040C 771 nt1.9□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.9□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YPR146CYPR146C 330 nt1.9□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 SPC72YAL047C 1869 nt1.9□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 POL3YDL102W 3294 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YER121WYER121W 345 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 AGA2YGL032C 264 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 ZEO1YOL109W 342 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YHR078WYHR078W 1659 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 KAP123YER110C 3342 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YSW1YBR148W 1830 nt1.89□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YDR250CYDR250C 276 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 RPS18BYML026C 441 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 FYV12YOR183W 390 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 KOG1YHR186C 4674 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 NOP14YDL148C 2433 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 LYS9YNR050C 1341 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 STB4YMR019W 2850 nt1.88□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 VPH1YOR270C 2523 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 SGD1YLR336C 2700 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 SMC6YLR383W 3345 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YGL069CYGL069C 465 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 MET18YIL128W 3099 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 MNE1YOR350C 1992 nt1.87□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 CRM1YGR218W 3255 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 URM1YIL008W 300 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 HSK3YKL138C-A 210 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 TRL1YJL087C 2484 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 ELG1YOR144C 2376 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 NOT5YPR072W 1683 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 CDC27YBL084C 2277 nt1.86□□□□□ -2.11
TPT1Q12272 SPP41YDR464W 4308 nt1.85□□□□□ -2.11
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