Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MET18YIL128W 3099 nt2.09□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 MUD2YKL074C 1584 nt2.09□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 ELG1YOR144C 2376 nt2.09□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SHE9YDR393W 1371 nt2.09□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 NIC96YFR002W 2520 nt2.09□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 PPN1YDR452W 2025 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 IRC10YOL015W 1761 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 RVS161YCR009C 798 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 PEX4YGR133W 552 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 AIM29YKR074W 468 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 COX7YMR256C 183 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SOK2YMR016C 2358 nt2.08□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 ECL1YGR146C 636 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YJL007CYJL007C 315 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YAR068WYAR068W 486 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SPC29YPL124W 762 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 RTC6YPL183W-A 282 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 TSC3YBR058C-A 243 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 STE11YLR362W 2154 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SCD5YOR329C 2619 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 DNA2YHR164C 4569 nt2.07□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 PHO91YNR013C 2685 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 VPS35YJL154C 2835 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SPC72YAL047C 1869 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YCR064CYCR064C 411 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SEC22YLR268W 645 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YLR269CYLR269C 351 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 TOM22YNL131W 459 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YOR333CYOR333C 417 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YPR039WYPR039W 336 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 snR54snR54 86 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SPO22YIL073C 2928 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 CRM1YGR218W 3255 nt2.06□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 VPH1YOR270C 2523 nt2.05□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YHR125WYHR125W 306 nt2.05□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.05□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SNC2YOR327C 348 nt2.05□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 TOR2YKL203C 7425 nt2.05□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SNX41YDR425W 1878 nt2.05□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 NUP120YKL057C 3114 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 LSO2YGR169C-A 279 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 TUS1YLR425W 3924 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 snR13snR13 124 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YPL205CYPL205C 345 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 snR41snR41 95 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SSD1YDR293C 3753 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 PDR3YBL005W 2931 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 COS111YBR203W 2775 nt2.04□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 MMS22YLR320W 4365 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 MNE1YOR350C 1992 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 SWT1YOR166C 1377 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 snR79snR79 84 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 ATP17YDR377W 306 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YDR509WYDR509W 348 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YGR025WYGR025W 303 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 NBL1YHR199C-A 222 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 TEN1YLR010C 483 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 KAR3YPR141C 2190 nt2.03□□□□□ -2.08
VAM3Q12241 MCD1YDL003W 1701 nt2.03□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 RUD3YOR216C 1455 nt2.02□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 RIC1YLR039C 3171 nt2.02□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 TRL1YJL087C 2484 nt2.02□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 RTT107YHR154W 3213 nt2.02□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 IST2YBR086C 2841 nt2.01□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 MSS11YMR164C 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YDR286CYDR286C 345 nt2.01□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 NUP170YBL079W 4509 nt2.01□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 SGD1YLR336C 2700 nt2.01□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 RTT101YJL047C 2529 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 RGA1YOR127W 3024 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 CDC27YBL084C 2277 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 CDC24YAL041W 2565 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 IES5YER092W 378 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YER121WYER121W 345 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 GET1YGL020C 708 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 HOP2YGL033W 657 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 MGM1YOR211C 2646 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 MSB1YOR188W 3414 nt2□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 BUB1YGR188C 3066 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YDL032WYDL032W 312 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 HUR1YGL168W 333 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YLR101CYLR101C 396 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 RPS22BYLR367W 393 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 GPX2YBR244W 489 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 DNF1YER166W 4716 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 COX1Q0045 1605 nt1.99□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YSW1YBR148W 1830 nt1.98□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 CDC60YPL160W 3273 nt1.98□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.98□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 TMN3YER113C 2121 nt1.98□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YGL069CYGL069C 465 nt1.98□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.98□□□□□ -2.09
VAM3Q12241 YLR053CYLR053C 327 nt1.98□□□□□ -2.09
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