Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YLR031WYLR031W 561 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 BER1YLR412W 825 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 ATP15YPL271W 189 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 DIS3YOL021C 3006 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 SPR3YGR059W 1539 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDL068WYDL068W 330 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDR220CYDR220C 294 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDR286CYDR286C 345 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 VOA1YGR106C 798 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 RMP1YLR145W 606 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 IRC20YLR247C 4671 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YPL197CYPL197C 414 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 ROX1YPR065W 1107 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 GRR1YJR090C 3456 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 SFB2YNL049C 2631 nt2.07□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDL016CYDL016C 303 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDR029WYDR029W 315 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YJR098CYJR098C 1971 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 ELG1YOR144C 2376 nt2.06□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 MGM1YOR211C 2646 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 HSH155YMR288W 2916 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 NUP82YJL061W 2142 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 snR84snR84 550 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YLR053CYLR053C 327 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YBL012CYBL012C 402 nt2.05□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 MET32YDR253C 576 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 HOP2YGL033W 657 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 SPO22YIL073C 2928 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 RPI1YIL119C 1224 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 MYO4YAL029C 4416 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 BUD2YKL092C 3315 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 CAT2YML042W 2013 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 MEI5YPL121C 669 nt2.04□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 RIC1YLR039C 3171 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 EMC4YGL231C 573 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 ILM1YJR118C 612 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YJR141WYJR141W 1044 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 ATG9YDL149W 2994 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 NAM7YMR080C 2916 nt2.03□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 NUP192YJL039C 5052 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 SYH1YPL105C 2550 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 RPL37BYDR500C 267 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 PRM8YGL053W 714 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 TEN1YLR010C 483 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 SNC2YOR327C 348 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YPR153WYPR153W 423 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YJL016WYJL016W 1686 nt2.02□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 NEO1YIL048W 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 NCE101YJL205C 162 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YKL044WYKL044W 321 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 RLP24YLR009W 600 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 PDR8YLR266C 2106 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YML084WYML084W 309 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 STB4YMR019W 2850 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 MGA2YIR033W 3342 nt2.01□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 VPS35YJL154C 2835 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 SEC31YDL195W 3822 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 RRF1YHR038W 693 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YKL111CYKL111C 336 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 UBX4YMR067C 1251 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 SVS1YPL163C 783 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 USO1YDL058W 5373 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 DCP2YNL118C 2913 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 ARP7YPR034W 1434 nt2□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 SEN15YMR059W 387 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YNL303WYNL303W 348 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 RCN2YOR220W 798 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 RTC6YPL183W-A 282 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 CDC27YBL084C 2277 nt1.99□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YDL062WYDL062W 426 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YDL118WYDL118W 381 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 BUD19YJL188C 309 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YKR051WYKR051W 1257 nt1.98□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 RPH1YER169W 2391 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 STE18YJR086W 333 nt1.97□□□□□ -2.09
SPE3Q12074 HCS1YKL017C 2052 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 YGL069CYGL069C 465 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 YPS5YGL259W 498 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 CIC1YHR052W 1131 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 SEC22YLR268W 645 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 YMR324CYMR324C 243 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 YBR071WYBR071W 636 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 GPX2YBR244W 489 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 MYO2YOR326W 4725 nt1.96□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 SET2YJL168C 2202 nt1.95□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 IRC10YOL015W 1761 nt1.95□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 MUD2YKL074C 1584 nt1.95□□□□□ -2.1
SPE3Q12074 CFT2YLR115W 2580 nt1.95□□□□□ -2.1
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